RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.27■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CLK1-211ENST00000481641 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 MTHFSP49914 203 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 GPR162Q16538 588 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.26■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 KDRP35968 1356 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 GNPATO15228 680 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 CABP4P57796 275 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK1-211ENST00000481641 HMOX1P09601 288 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 SSFA2P28290 1259 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 CHD4Q14839 1912 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CLK1-211ENST00000481641 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 LGR6Q9HBX8 967 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.09■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.09■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CLK1-211ENST00000481641 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
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CLK1-211ENST00000481641 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.07■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 MMP10P09238 476 aa25.06■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 SLC39A6Q13433 755 aa25.05■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 TJP1Q07157 1748 aa25.04■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 GRIN3BO60391 1043 aa25.04■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 RFC4P35249 363 aa25.03■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 GYS1P13807 737 aa25.02■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 ADRA2BP18089 450 aa25.02■■□□□ 1.6
CLK1-211ENST00000481641 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.01■■□□□ 1.59
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CLK1-211ENST00000481641 MRC1P22897 1456 aa25.01■■□□□ 1.59
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CLK1-211ENST00000481641 C4AP0C0L4 1744 aa25■■□□□ 1.59
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CLK1-211ENST00000481641 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.96■■□□□ 1.59
CLK1-211ENST00000481641 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 PPP2R1AP30153 589 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 FKBP8Q14318 412 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 IL17REQ8NFR9 667 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 CFAP53Q96M91 514 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.94■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.93■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 A0A0G2JLW4 131 aa24.92■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.92■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 PRKAR2BP31323 418 aa24.92■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.92■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.92■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.91■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.9■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 TGFB2P61812 414 aa24.89■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 DDR1Q08345 913 aa24.89■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 TEFQ10587 303 aa24.89■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.89■■□□□ 1.58
CLK1-211ENST00000481641 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.88■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 DPEP1P16444 411 aa24.88■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.88■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 ZPR1O75312 459 aa24.87■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 NUDCQ9Y266 331 aa24.87■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 ATP10DQ9P241 1426 aa24.86■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 C1QTNF8P60827 252 aa24.86■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.86■■□□□ 1.57
CLK1-211ENST00000481641 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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