RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 CFAP53Q96M91 514 aa8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 NUDCQ9Y266 331 aa8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 USP6P35125 1406 aa8.11□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 NWD1Q149M9 1564 aa8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 POLKQ9UBT6 870 aa8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.1□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 C3orf80F5H4A9 247 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 NEFLP07196 543 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 COG3Q96JB2 828 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 TSKSQ9UJT2 592 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 SSH2Q76I76 1423 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 STRCQ7RTU9 1775 aa8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SKAP2-204ENST00000481204 PIK3C2AO00443 1686 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 NEUROD2Q15784 382 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PEAK1Q9H792 1746 aa8.08□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF521Q96K83 1311 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 RUNDC1Q96C34 613 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.07□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS12P56730 875 aa8.06□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PDE3BQ13370 1112 aa8.06□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.06□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 ORAI2Q96SN7 254 aa8.06□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 HMOX1P09601 288 aa8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PTGDRQ13258 359 aa8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 GPR37O15354 613 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 IL13P35225 146 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 SLFN5Q08AF3 891 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 PADI6Q6TGC4 694 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 WWC1Q8IX03 1113 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM94Q12767 1356 aa8.04□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 USP31Q70CQ4 1352 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 SMAPO00193 183 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 CERKQ8TCT0 537 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.03□□□□□ -1.12
SKAP2-204ENST00000481204 USP54Q70EL1 1684 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 FOXO3O43524 673 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 PRKAR2BP31323 418 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 ABTB2Q8N961 1025 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 LTN1O94822 1766 aa8.02□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 PLIN1O60240 522 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 FECHP22830 423 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 PSME1Q06323 249 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 TTC13Q8NBP0 860 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.01□□□□□ -1.13
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms