RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AK7Q96M32 723 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCAF5Q96JK2 942 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTHFSP49914 203 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KLHL34Q8N239 644 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATG3Q9NT62 314 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MSL1Q68DK7 614 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ITPK1Q13572 414 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP6V1AP38606 617 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHF14O94880 888 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SSFA2P28290 1259 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CABP4P57796 275 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMIM5Q71RC9 77 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GNPATO15228 680 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HMOX1P09601 288 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHD4Q14839 1912 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPR162Q16538 588 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRC1P22897 1456 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TJP1Q07157 1748 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LGR6Q9HBX8 967 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C4AP0C0L4 1744 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPS6KA4O75676 772 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MMP10P09238 476 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFAP53Q96M91 514 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIN3BO60391 1043 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RFC4P35249 363 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC39A6Q13433 755 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GYS1P13807 737 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP2R1AP30153 589 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRKAR2BP31323 418 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NUDCQ9Y266 331 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IL17REQ8NFR9 667 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TEFQ10587 303 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms