RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460955.5

AC004889.1-202, humanhuman

TSL 4

Gene AC004889.1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-202ENST00000460955 AK7Q96M32 723 aa24.24■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 ATP6V1AP38606 617 aa24.23■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 KLHL34Q8N239 644 aa24.23■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.22■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.22■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.22■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 C4BP0C0L5 1744 aa24.21■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.21■■□□□ 1.47
AC004889.1-202ENST00000460955 ITPK1Q13572 414 aa24.2■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 CFAP53Q96M91 514 aa24.2■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 GPR162Q16538 588 aa24.18■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.18■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 PHF14O94880 888 aa24.17■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 PPP2R1AP30153 589 aa24.16■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 MSL1Q68DK7 614 aa24.16■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.16■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 SMIM5Q71RC9 77 aa24.15■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.15■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 LGR6Q9HBX8 967 aa24.15■■□□□ 1.46
AC004889.1-202ENST00000460955 GNPATO15228 680 aa24.14■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 SSFA2P28290 1259 aa24.14■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 MAP3K5Q99683 1374 aa24.14■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.13■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.13■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 NUDCQ9Y266 331 aa24.13■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.11■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.11■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.1■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.08■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
AC004889.1-202ENST00000460955 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 PRKAR2BP31323 418 aa24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 MRC1P22897 1456 aa24.07■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.06■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.05■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 SLC39A6Q13433 755 aa24.05■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.05■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 CHD4Q14839 1912 aa24.05■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 RPS6KA4O75676 772 aa24.03■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.03■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.02■■□□□ 1.44
AC004889.1-202ENST00000460955 FCHSD2O94868 740 aa24.01■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 TEFQ10587 303 aa24■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 IL17REQ8NFR9 667 aa24■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 RFC4P35249 363 aa23.99■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.99■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.98■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.98■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 C1QTNF8P60827 252 aa23.97■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 TJP1Q07157 1748 aa23.97■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.96■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.96■■□□□ 1.43
AC004889.1-202ENST00000460955 MMP10P09238 476 aa23.95■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.95■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.94■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.94■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 RALBP1Q15311 655 aa23.94■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.94■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 GRIN3BO60391 1043 aa23.93■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 GYS1P13807 737 aa23.93■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 NEFMP07197 916 aa23.92■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 ZNF790Q6PG37 636 aa23.92■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 MCM10Q7L590 875 aa23.9■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
AC004889.1-202ENST00000460955 BTBD11A6QL63 1104 aa23.89■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.89■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.88■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 C4AP0C0L4 1744 aa23.88■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 STARD3NLO95772 234 aa23.88■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.88■■□□□ 1.41
AC004889.1-202ENST00000460955 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms