RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434451.1

TNS3-205, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TNS3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-205ENST00000434451 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
TNS3-205ENST00000434451 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.45■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 AK7Q96M32 723 aa22.45■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.45■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 MRC1P22897 1456 aa22.44■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 SYT17Q9BSW7 474 aa22.44■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 CABP4P57796 275 aa22.42■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.42■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 HMOX1P09601 288 aa22.41■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 SSFA2P28290 1259 aa22.41■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 ATP6V1AP38606 617 aa22.41■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.41■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 MSH5O43196 834 aa22.4■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 ITPK1Q13572 414 aa22.4■■□□□ 1.18
TNS3-205ENST00000434451 CFAP53Q96M91 514 aa22.38■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 TJP1Q07157 1748 aa22.37■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.35■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.35■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.35■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.35■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 GNPATO15228 680 aa22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.34■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 PHF14O94880 888 aa22.33■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 PPP2R1AP30153 589 aa22.33■■□□□ 1.17
TNS3-205ENST00000434451 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.33■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 MSL1Q68DK7 614 aa22.32■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 C4AP0C0L4 1744 aa22.31■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 CHD4Q14839 1912 aa22.31■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 ADRA2BP18089 450 aa22.31■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.31■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 LGR6Q9HBX8 967 aa22.3■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 NUDCQ9Y266 331 aa22.3■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 KLHL34Q8N239 644 aa22.29■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.29■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 YY1P25490 414 aa22.27■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.27■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.27■■□□□ 1.16
TNS3-205ENST00000434451 RPS6KA4O75676 772 aa22.26■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.26■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 SMIM5Q71RC9 77 aa22.26■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.25■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 PRKAR2BP31323 418 aa22.24■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.24■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.24■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.23■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 FCHSD2O94868 740 aa22.22■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.22■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 UTRNP46939 3433 aa22.22■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 GPR162Q16538 588 aa22.21■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.21■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TNS3-205ENST00000434451 RFC4P35249 363 aa22.2■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 TEFQ10587 303 aa22.2■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 SLC39A6Q13433 755 aa22.2■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 IL17REQ8NFR9 667 aa22.2■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.2■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.19■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.18■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.18■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 MMP10P09238 476 aa22.17■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 GYS1P13807 737 aa22.17■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.16■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 GRIN3BO60391 1043 aa22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 RALBP1Q15311 655 aa22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 ZNF790Q6PG37 636 aa22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.14■■□□□ 1.14
TNS3-205ENST00000434451 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.14■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 COL15A1P39059 1388 aa22.12■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 NEFMP07197 916 aa22.11■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.11■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.1■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 STARD3NLO95772 234 aa22.1■■□□□ 1.13
TNS3-205ENST00000434451 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms