RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 DPEP1P16444 411 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP6V1AP38606 617 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 FYB1O15117 783 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 TMF1P82094 1093 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 FLT4P35916 1363 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.46■■□□□ 1.35
ANKRD54-206ENST00000424350 TESK2Q96S53 571 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 RRAGCQ9HB90 399 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 SPG7Q9UQ90 795 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 KCNA3P22001 575 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 ATG3Q9NT62 314 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 RNF181Q9P0P0 153 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.42■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 GYS1P13807 737 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 PIM2Q9P1W9 311 aa23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 DCAF5Q96JK2 942 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 C4AP0C0L4 1744 aa23.39■■□□□ 1.34
ANKRD54-206ENST00000424350 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 ADRA2BP18089 450 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 RFC4P35249 363 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 NCAPD2Q15021 1401 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.38■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 KDRP35968 1356 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 SLC24A1O60721 1099 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 PHKG2P15735 406 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.36■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 RPS6KA4O75676 772 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 TONSLQ96HA7 1378 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD54-206ENST00000424350 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.33■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 EYA1Q99502 592 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 CHRNA5P30532 468 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 SBF1O95248 1867 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 DDR1Q08345 913 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 FKBP8Q14318 412 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 RASSF7Q02833 373 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 GLTPD2A6NH11 291 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 LMNB1P20700 586 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD54-206ENST00000424350 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 CABP4P57796 275 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 TM4SF1P30408 202 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 POLKQ9UBT6 870 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 POTECB2RU33 542 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 SLC34A2O95436 690 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-206ENST00000424350 CDCA8Q53HL2 280 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 CREBZFQ9NS37 354 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 ZPR1O75312 459 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 TTLL6Q8N841 843 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 FOXN1O15353 648 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 NFKBIEO00221 500 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 MTHFSP49914 203 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-206ENST00000424350 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms