RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.01■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIK1P57059 783 aa22.01■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITPK1Q13572 414 aa22.01■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.01■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 C1orf141Q5JVX7 400 aa22■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.99■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.98■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 LGR6Q9HBX8 967 aa21.98■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP53Q96M91 514 aa21.97■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.97■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.96■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.96■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.96■■□□□ 1.11
NME1-NME2-202ENST00000393193 CABP4P57796 275 aa21.95■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.95■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.95■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 C4AP0C0L4 1744 aa21.94■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.93■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K5Q99683 1374 aa21.93■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRKAR2BP31323 418 aa21.92■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP6V1AP38606 617 aa21.91■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL17REQ8NFR9 667 aa21.9■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.9■■□□□ 1.1
NME1-NME2-202ENST00000393193 FCHSD2O94868 740 aa21.89■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 RALBP1Q15311 655 aa21.89■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMIM5Q71RC9 77 aa21.89■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUDCQ9Y266 331 aa21.89■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.88■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 SSFA2P28290 1259 aa21.88■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.88■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 AK7Q96M32 723 aa21.87■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.86■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARXQ96QS3 562 aa21.86■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.85■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC39A6Q13433 755 aa21.84■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYT17Q9BSW7 474 aa21.84■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNPATO15228 680 aa21.83■■□□□ 1.09
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.82■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPS6KA4O75676 772 aa21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHF14O94880 888 aa21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSL1Q68DK7 614 aa21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.8■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.79■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADRA2BP18089 450 aa21.78■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLD1P28340 1107 aa21.78■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.78■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 UTRNP46939 3433 aa21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSH5O43196 834 aa21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF790Q6PG37 636 aa21.76■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.75■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEFQ10587 303 aa21.75■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNQ3O43525 872 aa21.74■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 MCM10Q7L590 875 aa21.74■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCTN1Q14203 1278 aa21.73■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.73■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 GYS1P13807 737 aa21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHD4Q14839 1912 aa21.72■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFE2L2Q16236 605 aa21.71■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.71■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCN7AQ01118 1682 aa21.71■■□□□ 1.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.7■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.69■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCORQ6W2J9 1755 aa21.69■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 BTBD11A6QL63 1104 aa21.68■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.68■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms