RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
NME4-202ENST00000382940 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.2■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 PHF14O94880 888 aa29.19■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.19■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 C4BP0C0L5 1744 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 PPP2R1AP30153 589 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 KLHL34Q8N239 644 aa29.18■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 ITPK1Q13572 414 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 SYT17Q9BSW7 474 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 NUDCQ9Y266 331 aa29.17■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 GNPATO15228 680 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 MSL1Q68DK7 614 aa29.15■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
NME4-202ENST00000382940 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.13■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 SSFA2P28290 1259 aa29.13■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 LGR6Q9HBX8 967 aa29.12■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.11■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 MAP3K5Q99683 1374 aa29.1■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 SMIM5Q71RC9 77 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.09■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
NME4-202ENST00000382940 PRKAR2BP31323 418 aa29.07■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.05■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.04■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.04■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.04■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 SCN11AQ9UI33 1791 aa29.03■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 MRC1P22897 1456 aa29.03■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 TEFQ10587 303 aa29.02■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.02■■■□□ 2.24
NME4-202ENST00000382940 SLC39A6Q13433 755 aa29.01■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.01■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 COL24A1Q17RW2 1714 aa29■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 ADRA2BP18089 450 aa29■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 PHACTR3Q96KR7 559 aa29■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 FCHSD2O94868 740 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.99■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 RPS6KA4O75676 772 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 RFC4P35249 363 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 GPR162Q16538 588 aa28.98■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 NEFMP07197 916 aa28.97■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 YY1P25490 414 aa28.97■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-202ENST00000382940 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 IL17REQ8NFR9 667 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 RALBP1Q15311 655 aa28.94■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.92■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.92■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 MMP10P09238 476 aa28.9■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.9■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.89■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 ZNF790Q6PG37 636 aa28.89■■■□□ 2.22
NME4-202ENST00000382940 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 TJP1Q07157 1748 aa28.88■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.88■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 BTBD11A6QL63 1104 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 STARD3NLO95772 234 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 GYS1P13807 737 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 MCM10Q7L590 875 aa28.85■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.84■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 ZPR1O75312 459 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-202ENST00000382940 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.81■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.81■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 GRIN3BO60391 1043 aa28.8■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 DCTN1Q14203 1278 aa28.8■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
NME4-202ENST00000382940 COL15A1P39059 1388 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms