RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 HMOX1P09601 288 aa23.11■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 CFAP53Q96M91 514 aa23.11■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 MAP3K5Q99683 1374 aa23.11■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.1■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 SSFA2P28290 1259 aa23.08■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 KLHL34Q8N239 644 aa23.08■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.08■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 PHF14O94880 888 aa23.06■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.05■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 GNPATO15228 680 aa23.05■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 ITPK1Q13572 414 aa23.05■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.05■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 MSL1Q68DK7 614 aa23.04■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 NUDCQ9Y266 331 aa23.03■■□□□ 1.28
USP11-202ENST00000377078 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.01■■□□□ 1.27
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USP11-202ENST00000377078 YY1P25490 414 aa23.01■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 SCN11AQ9UI33 1791 aa23■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23■■□□□ 1.27
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USP11-202ENST00000377078 PPP2R1AP30153 589 aa22.99■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.99■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.99■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.98■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 ADRA2BP18089 450 aa22.97■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 GPR162Q16538 588 aa22.97■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.97■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.97■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 LGR6Q9HBX8 967 aa22.97■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 UTRNP46939 3433 aa22.96■■□□□ 1.27
USP11-202ENST00000377078 MRC1P22897 1456 aa22.95■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.95■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 SMIM5Q71RC9 77 aa22.94■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.93■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 RPS6KA4O75676 772 aa22.93■■□□□ 1.26
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USP11-202ENST00000377078 RFC4P35249 363 aa22.93■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 PRKAR2BP31323 418 aa22.92■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 TEFQ10587 303 aa22.92■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.92■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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USP11-202ENST00000377078 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.9■■□□□ 1.26
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USP11-202ENST00000377078 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.9■■□□□ 1.26
USP11-202ENST00000377078 FCHSD2O94868 740 aa22.89■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 SLC39A6Q13433 755 aa22.89■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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USP11-202ENST00000377078 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.87■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 GRIN3BO60391 1043 aa22.86■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP11-202ENST00000377078 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.86■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 TJP1Q07157 1748 aa22.85■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 IL17REQ8NFR9 667 aa22.85■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.85■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.83■■□□□ 1.25
USP11-202ENST00000377078 GYS1P13807 737 aa22.83■■□□□ 1.25
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USP11-202ENST00000377078 RALBP1Q15311 655 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 ZNF790Q6PG37 636 aa22.82■■□□□ 1.24
USP11-202ENST00000377078 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.82■■□□□ 1.24
USP11-202ENST00000377078 CHD4Q14839 1912 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 ZPR1O75312 459 aa22.81■■□□□ 1.24
USP11-202ENST00000377078 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 C4AP0C0L4 1744 aa22.79■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP11-202ENST00000377078 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.78■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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USP11-202ENST00000377078 TGFB2P61812 414 aa22.76■■□□□ 1.23
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