RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 USP6P35125 1406 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 APPP05067 770 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 VPS37DQ86XT2 251 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.18□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGEF10O15013 1369 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 WASHC4Q2M389 1173 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.17□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 PPLO60437 1756 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF4Q96M43 638 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 STARD3NLO95772 234 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.16□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 RICTORQ6R327 1708 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 MX1P20591 662 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 LGR6Q9HBX8 967 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 RNF20Q5VTR2 975 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.15□□□□□ -0.46
TTPAL-202ENST00000372904 AGLP35573 1532 aa12.15□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.15□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 PTPRMP28827 1452 aa12.15□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 EXOC5O00471 708 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 NUCB1Q02818 461 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 G2E3Q7L622 706 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.14□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 H3BQV1 296 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 NFKBIBQ15653 356 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 IFFO2Q5TF58 517 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 NEK4P51957 841 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 RAB11FIP3O75154 756 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 FBXW7Q969H0 707 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 FOSBP53539 338 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 FAM184AQ8NB25 1140 aa12.13□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM94Q12767 1356 aa12.12□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.12□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 NGLY1Q96IV0 654 aa12.12□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.12□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.12□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 IL2RBP14784 551 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 RABEP1Q15276 862 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CHL1O00533 1208 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF521Q96K83 1311 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WZG4 1122 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.11□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 GPTP24298 496 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 MCTP1Q6DN14 999 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 HIP1O00291 1037 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 COPS6Q7L5N1 327 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 BTG4Q9NY30 223 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.1□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 SLAIN2Q9P270 581 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 CEP85Q6P2H3 762 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.09□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 GSE1Q14687 1217 aa12.08□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 C8orf34Q49A92 452 aa12.08□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.08□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.08□□□□□ -0.47
TTPAL-202ENST00000372904 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.08□□□□□ -0.48
TTPAL-202ENST00000372904 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.08□□□□□ -0.48
TTPAL-202ENST00000372904 ADGRB1O14514 1584 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms