RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ERBB3P21860 1342 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 RGS12O14924 1447 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 COL18A1P39060 1754 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 PTPRCP08575 1304 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 LGR6Q9HBX8 967 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC6O95255 1503 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A2P04920 1241 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS1-204ENST00000352260 CPDO75976 1380 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 SMC5Q8IY18 1101 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 CHRNA2Q15822 529 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 G2E3Q7L622 706 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 CLCN1P35523 988 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 STK31Q9BXU1 1019 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 FSD2A1L4K1 749 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 TEFQ10587 303 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS1-204ENST00000352260 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 PHLPP1O60346 1717 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 NECTIN2Q92692 538 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 MEGF6O75095 1541 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 BTBD11A6QL63 1104 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 KCNQ3O43525 872 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 FLIIQ13045 1269 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 F6X3S4 739 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 HOXB7P09629 217 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 NUCB1Q02818 461 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 ABCA3Q99758 1704 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 CACNA1FO60840 1977 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-204ENST00000352260 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 GCC1Q96CN9 775 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 JCADQ9P266 1359 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 SPG7Q9UQ90 795 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 ATP10DQ9P241 1426 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 MEIS3Q99687 375 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 PHKG2P15735 406 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 MRE11P49959 708 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 LNPKQ9C0E8 428 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 MCM4P33991 863 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-204ENST00000352260 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 CEP85Q6P2H3 762 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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