RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 STRN4Q9NRL3 753 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 KCNQ3O43525 872 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 CYP27B1O15528 508 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 RGS12O14924 1447 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 TOM1O60784 492 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 HOXB7P09629 217 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 G2E3Q7L622 706 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 NECTIN2Q92692 538 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 DCAF5Q96JK2 942 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 BTG4Q9NY30 223 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-201ENST00000331803 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 IL2RBP14784 551 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 PIP4K2BP78356 416 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 FLIIQ13045 1269 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 PHLPP1O60346 1717 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 CACNA1FO60840 1977 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 ZNF790Q6PG37 636 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-201ENST00000331803 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 F6X3S4 739 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 RGS3P49796 1198 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 USP35Q9P2H5 1018 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 MRC1P22897 1456 aa24.19■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.19■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.19■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A6Q13433 755 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 CABP4P57796 275 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.17■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 SMC5Q8IY18 1101 aa24.15■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.14■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS2O95450 1211 aa24.14■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 PDE4AP27815 886 aa24.14■■□□□ 1.46
UPP1-201ENST00000331803 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.13■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 MEIS3Q99687 375 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 BACH2Q9BYV9 841 aa24.12■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.11■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 ANXA1P04083 346 aa24.1■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.09■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 DISP2A7MBM2 1401 aa24.08■■□□□ 1.45
UPP1-201ENST00000331803 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 GCC1Q96CN9 775 aa24.08■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 PROSER3Q2NL68 480 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 HYPKQ9NX55 129 aa24.07■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 NUCB1Q02818 461 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.06■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 ATP10DQ9P241 1426 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 CEP85Q6P2H3 762 aa24.05■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 PDIA6Q15084 440 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 FAM161AQ3B820 660 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 C5P01031 1676 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 GNAI3P08754 354 aa24.04■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 GNAI2P04899 355 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 USP16Q9Y5T5 823 aa24.03■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 ADCY9O60503 1353 aa24.02■■□□□ 1.44
UPP1-201ENST00000331803 EXOC5O00471 708 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms