RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.84■□□□□ 0.93
CHTF18-202ENST00000317063 IL2RBP14784 551 aa20.82■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 HSPA1LP34931 641 aa20.82■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 BTBD11A6QL63 1104 aa20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 C8orf37Q96NL8 207 aa20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM27P14373 513 aa20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC37A3O60309 1634 aa20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 SLC39A6Q13433 755 aa20.79■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 11.9
CHTF18-202ENST00000317063 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.78■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.78■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 FGD1P98174 961 aa20.77■□□□□ 0.92
CHTF18-202ENST00000317063 PDE3AQ14432 1141 aa20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 NGLY1Q96IV0 654 aa20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 SLC4A2P04920 1241 aa20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 JCADQ9P266 1359 aa20.74■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.74■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 G2E3Q7L622 706 aa20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF5Q96JK2 942 aa20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF428Q96B54 188 aa20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.72■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.72■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.72■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 KIF16BQ96L93 1317 aa20.71■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 CABP4P57796 275 aa20.71■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.71■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.71■□□□□ 0.91
CHTF18-202ENST00000317063 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 AAMPQ13685 434 aa20.7■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 ANXA1P04083 346 aa20.7■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.7■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.69■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF790Q6PG37 636 aa20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 LRP6O75581 1613 aa20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SKAP1Q86WV1 359 aa20.67■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 EXOC5O00471 708 aa20.67■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 F6X3S4 739 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 STK31Q9BXU1 1019 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SLIT2O94813 1529 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 NRAPQ86VF7 1730 aa20.66■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.65■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.65■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CHTF18-202ENST00000317063 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.64■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 A0A0G2JS52 829 aa20.64■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.64■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 DISP2A7MBM2 1401 aa20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 USP21Q9UK80 565 aa20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 IGHDP01880 384 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 PROSER3Q2NL68 480 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 MS4A1P11836 297 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 DDB1Q16531 1140 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 FLIIQ13045 1269 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-202ENST00000317063 USP16Q9Y5T5 823 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms