RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 ADGRL2O95490 1459 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 MCM5P33992 734 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 USP8P40818 1118 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 TTC22Q5TAA0 569 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 EID1Q9Y6B2 187 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 SRGAP3O43295 1099 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 SIL1Q9H173 461 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 NUP160Q12769 1436 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 ABCC11Q96J66 1382 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 OFD1O75665 1012 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 MX1P20591 662 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 ADCY5O95622 1261 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 WASHC4Q2M389 1173 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 VAMP4O75379 141 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNS1-201ENST00000306117 SMARCE1Q969G3 411 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 SNX21Q969T3 373 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 GPATCH11Q8N954 259 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 USP19O94966 1318 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 TIGD1Q96MW7 591 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 TMX3Q96JJ7 454 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 SPG7Q9UQ90 795 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ADGRL1O94910 1474 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 POLKQ9UBT6 870 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP100Q494V2 611 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 FAM177BA6PVY3 158 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 MBD5Q9P267 1494 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PKP1Q13835 747 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ABTB2Q8N961 1025 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 RBSNQ9H1K0 784 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 ERICH2A1L162 156 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PPFIA3O75145 1194 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNS1-201ENST00000306117 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 OSCARQ8IYS5 282 aa18.27■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 IL16Q14005 1332 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ANXA1P04083 346 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 DDX11Q96FC9 970 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP45Q9UL16 551 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 A0A1W2PP64 1363 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms