RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.36■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.36■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 SSFA2P28290 1259 aa25.33■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.33■■□□□ 1.65
MALSU1-201ENST00000287543 ITPK1Q13572 414 aa25.32■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.32■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 FCHSD2O94868 740 aa25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 SYT17Q9BSW7 474 aa25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 LGR6Q9HBX8 967 aa25.3■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.28■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 RALBP1Q15311 655 aa25.28■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.28■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 ITGB4P16144 1822 aa25.28■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 GNPATO15228 680 aa25.27■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 PRKAR2BP31323 418 aa25.27■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 MAP3K5Q99683 1374 aa25.27■■□□□ 1.64
MALSU1-201ENST00000287543 PHF14O94880 888 aa25.26■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.26■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.26■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 ADRA2BP18089 450 aa25.25■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.25■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.24■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 C5P01031 1676 aa25.23■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 NEFMP07197 916 aa25.23■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 TEFQ10587 303 aa25.23■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 C4BP0C0L5 1744 aa25.23■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.22■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 RPS6KA4O75676 772 aa25.21■■□□□ 1.63
MALSU1-201ENST00000287543 MSL1Q68DK7 614 aa25.2■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.2■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.2■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 IL17REQ8NFR9 667 aa25.2■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 MRC1P22897 1456 aa25.2■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.19■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 KLHL34Q8N239 644 aa25.18■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 SLC39A6Q13433 755 aa25.17■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 RFC4P35249 363 aa25.16■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.16■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.16■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 SMIM5Q71RC9 77 aa25.15■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.15■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
MALSU1-201ENST00000287543 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.14■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF790Q6PG37 636 aa25.13■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.13■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.13■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 STARD3NLO95772 234 aa25.12■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.12■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.1■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.1■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 BTBD11A6QL63 1104 aa25.1■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.1■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.09■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.09■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 GPR162Q16538 588 aa25.08■■□□□ 1.61
MALSU1-201ENST00000287543 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.08■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 MMP10P09238 476 aa25.07■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.07■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 GYS1P13807 737 aa25.06■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.05■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 MCM10Q7L590 875 aa25.05■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.05■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.05■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.05■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 ZPR1O75312 459 aa25.04■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 YY1P25490 414 aa25.04■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 NFE2L2Q16236 605 aa25.04■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.03■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 GRIN3BO60391 1043 aa25.02■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
MALSU1-201ENST00000287543 A0A087WZG4 1122 aa25.01■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.01■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 DCTN1Q14203 1278 aa25■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms