RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.9■■□□□ 1.74
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UBE2B-201ENST00000265339 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
UBE2B-201ENST00000265339 PLIN1O60240 522 aa25.89■■□□□ 1.73
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UBE2B-201ENST00000265339 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.88■■□□□ 1.73
UBE2B-201ENST00000265339 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.88■■□□□ 1.73
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UBE2B-201ENST00000265339 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBE2B-201ENST00000265339 NECTIN2Q92692 538 aa25.58■■□□□ 1.69
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UBE2B-201ENST00000265339 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.58■■□□□ 1.68
UBE2B-201ENST00000265339 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.57■■□□□ 1.68
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