RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.52■■□□□ 1.68
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ODC1-201ENST00000234111 KRT24Q2M2I5 525 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 PDE1AP54750 535 aa25.51■■□□□ 1.67
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ODC1-201ENST00000234111 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ODC1-201ENST00000234111 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
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ODC1-201ENST00000234111 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.33■■□□□ 1.65
ODC1-201ENST00000234111 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.32■■□□□ 1.64
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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