RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa29.28■■■□□ 2.28
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phkg2Q9DB30 406 aa29.27■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa29.27■■■□□ 2.28
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa29.26■■■□□ 2.28
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chmp7Q8R1T1 451 aa29.11■■■□□ 2.25
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kndc1Q0KK55 1742 aa29.11■■■□□ 2.25
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrc43Q3V0L5 667 aa29.06■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col24a1Q30D77 1733 aa29.05■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 XpcP51612 930 aa29.03■■■□□ 2.24
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdhd1P59328 1117 aa29.02■■■□□ 2.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r1bQ60829 194 aa29.02■■■□□ 2.24
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col4a5Q63ZW6 1691 aa29.01■■■□□ 2.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clcn1Q64347 994 aa28.97■■■□□ 2.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc155Q80VJ8 648 aa28.97■■■□□ 2.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Amotl1Q9D4H4 968 aa28.93■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r15aP17564 657 aa28.92■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DaglaQ6WQJ1 1044 aa28.92■■■□□ 2.22
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nav1Q8CH77 1875 aa28.91■■■□□ 2.22
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atf5O70191 283 aa28.9■■■□□ 2.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spire2Q8K1S6 718 aa28.9■■■□□ 2.22
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm16440K7N6G6 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm2244L7N2A3 218 aa28.88■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3278L7N2D2 218 aa28.88■■■□□ 2.21
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dusp27Q148W8 1138 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp19Q3UJD6 1360 aa28.86■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd248Q91V98 765 aa28.85■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NpcdF8VQB8 469 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mcm10Q0VBD2 885 aa28.84■■■□□ 2.21
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