RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CenphQ9QYM8 241 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Jakmip2D3YXK0 820 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Phf14Q9D4H9 881 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tnni2P13412 182 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Erich4Q3UNU4 136 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Grin2aP35436 1464 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prkar2bP31324 416 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem87bQ8BKU8 555 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa14.6□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Skida1Q80YR3 822 aa14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Smtnl1Q99LM3 459 aa14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Strn4P58404 760 aa14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Def6Q8C2K1 630 aa14.58□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slu7Q8BHJ9 585 aa14.58□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Polr3dQ91WD1 398 aa14.58□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 ZwintQ9CQU5 252 aa14.58□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tsg101Q61187 391 aa14.58□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 ItpripQ3TNL8 555 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccne1Q61457 408 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AI481877A2ALV5 1481 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pik3r4Q8VD65 1358 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ces1hD3Z298 562 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GnpatP98192 678 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Irf9Q61179 399 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cdan1Q8CC12 1239 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rad23bP54728 416 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Skap1Q3UUV5 355 aa14.57□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Exoc5Q3TPX4 708 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ankle2Q6P1H6 964 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Farp2Q91VS8 1065 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cul5Q9D5V5 780 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Traf3ip1Q149C2 625 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gnat3Q3V3I2 354 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gjb2Q00977 226 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atp10dQ8K2X1 1416 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ssh1Q76I79 1042 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hoxb7P09024 217 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem67Q8BR76 992 aa14.56□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GlmnQ8BZM1 596 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rsph6aQ8CDR2 708 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gas2l3Q3UWW6 683 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prr29B1ARI9 187 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Soga3Q6NZL0 945 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Samm50Q8BGH2 469 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cetn1P41209 172 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slf2Q6P9P0 1278 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Themis2Q91YX0 663 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 MicalclQ9D5U9 680 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Myd88P22366 296 aa14.55□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ces1aE9PYP1 563 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Camsap2Q8C1B1 1461 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Speer4dL7N216 212 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Otud6bQ8K2H2 294 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pof1bQ8K4L4 587 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gps2Q921N8 327 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Izumo3A6PWV3 263 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gbp4Q61107 620 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gimap5Q8BWF2 308 aa14.54□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PaskQ8CEE6 1383 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Txndc16Q7TN22 820 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fam13bQ8K2H3 851 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rapgef3Q8VCC8 918 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Kcnj4P52189 445 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Limch1Q3UH68 1057 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cwc25Q9DBF7 416 aa14.53□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nphp3Q7TNH6 1325 aa14.52□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 VeztQ3ZK22 780 aa14.52□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Api5O35841 504 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Acsbg1Q99PU5 721 aa14.52□□□□□ -0.08
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hook3Q8BUK6 718 aa14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Plekho1Q9JIY0 408 aa14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc12a5Q91V14 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Arid3aQ62431 601 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bag4Q8CI61 457 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sall3Q62255 1320 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ampd3O08739 766 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tacc1Q6Y685 774 aa14.51□□□□□ -0.09
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ifit1bl2Q3U687 466 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52 ms