Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Gm17190V9GX38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gm17190V9GX38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gm17190V9GX38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gm17190V9GX38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm17190V9GX38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm17190V9GX38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm17190V9GX38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm17190V9GX38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm17190V9GX38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm17190V9GX38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm17190V9GX38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm17190V9GX38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm17190V9GX38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm17190V9GX38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm17190V9GX38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm17190V9GX38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm17190V9GX38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm17190V9GX38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm17190V9GX38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm17190V9GX38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm17190V9GX38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm17190V9GX38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm17190V9GX38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm17190V9GX38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm17190V9GX38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm17190V9GX38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm17190V9GX38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm17190V9GX38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm17190V9GX38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm17190V9GX38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm17190V9GX38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm17190V9GX38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm17190V9GX38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm17190V9GX38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm17190V9GX38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm17190V9GX38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gm17190V9GX38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm17190V9GX38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm17190V9GX38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm17190V9GX38 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm17190V9GX38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm17190V9GX38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm17190V9GX38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm17190V9GX38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm17190V9GX38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm17190V9GX38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm17190V9GX38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm17190V9GX38 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm17190V9GX38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm17190V9GX38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm17190V9GX38 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm17190V9GX38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm17190V9GX38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm17190V9GX38 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm17190V9GX38 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm17190V9GX38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm17190V9GX38 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm17190V9GX38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm17190V9GX38 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm17190V9GX38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm17190V9GX38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm17190V9GX38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm17190V9GX38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm17190V9GX38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm17190V9GX38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm17190V9GX38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm17190V9GX38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm17190V9GX38 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm17190V9GX38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm17190V9GX38 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm17190V9GX38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm17190V9GX38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm17190V9GX38 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm17190V9GX38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm17190V9GX38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm17190V9GX38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm17190V9GX38 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm17190V9GX38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm17190V9GX38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm17190V9GX38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm17190V9GX38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm17190V9GX38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm17190V9GX38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm17190V9GX38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm17190V9GX38 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm17190V9GX38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm17190V9GX38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm17190V9GX38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm17190V9GX38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm17190V9GX38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm17190V9GX38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm17190V9GX38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm17190V9GX38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17190V9GX38 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm17190V9GX38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17190V9GX38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17190V9GX38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17190V9GX38 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm17190V9GX38 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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