Protein–RNA interactions for Protein: S4R213

Lactbl1, Lactamase, beta-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactbl1S4R213 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lactbl1S4R213 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Lactbl1S4R213 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lactbl1S4R213 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lactbl1S4R213 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Lactbl1S4R213 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lactbl1S4R213 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lactbl1S4R213 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lactbl1S4R213 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lactbl1S4R213 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Lactbl1S4R213 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lactbl1S4R213 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lactbl1S4R213 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lactbl1S4R213 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lactbl1S4R213 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lactbl1S4R213 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lactbl1S4R213 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lactbl1S4R213 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lactbl1S4R213 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Lactbl1S4R213 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lactbl1S4R213 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Lactbl1S4R213 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lactbl1S4R213 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lactbl1S4R213 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lactbl1S4R213 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Lactbl1S4R213 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lactbl1S4R213 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Lactbl1S4R213 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lactbl1S4R213 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lactbl1S4R213 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lactbl1S4R213 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lactbl1S4R213 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lactbl1S4R213 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lactbl1S4R213 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lactbl1S4R213 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lactbl1S4R213 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lactbl1S4R213 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Lactbl1S4R213 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lactbl1S4R213 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lactbl1S4R213 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lactbl1S4R213 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lactbl1S4R213 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lactbl1S4R213 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lactbl1S4R213 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lactbl1S4R213 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lactbl1S4R213 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lactbl1S4R213 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lactbl1S4R213 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lactbl1S4R213 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lactbl1S4R213 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lactbl1S4R213 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lactbl1S4R213 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lactbl1S4R213 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lactbl1S4R213 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lactbl1S4R213 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lactbl1S4R213 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lactbl1S4R213 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lactbl1S4R213 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lactbl1S4R213 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lactbl1S4R213 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lactbl1S4R213 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lactbl1S4R213 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lactbl1S4R213 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lactbl1S4R213 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lactbl1S4R213 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lactbl1S4R213 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lactbl1S4R213 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lactbl1S4R213 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lactbl1S4R213 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lactbl1S4R213 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lactbl1S4R213 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lactbl1S4R213 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lactbl1S4R213 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lactbl1S4R213 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lactbl1S4R213 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lactbl1S4R213 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lactbl1S4R213 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lactbl1S4R213 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lactbl1S4R213 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lactbl1S4R213 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lactbl1S4R213 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lactbl1S4R213 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lactbl1S4R213 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lactbl1S4R213 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lactbl1S4R213 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lactbl1S4R213 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lactbl1S4R213 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lactbl1S4R213 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lactbl1S4R213 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lactbl1S4R213 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lactbl1S4R213 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lactbl1S4R213 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lactbl1S4R213 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lactbl1S4R213 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lactbl1S4R213 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 759.7 ms