Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CcniQ9Z2V9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CcniQ9Z2V9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CcniQ9Z2V9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CcniQ9Z2V9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CcniQ9Z2V9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CcniQ9Z2V9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CcniQ9Z2V9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CcniQ9Z2V9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CcniQ9Z2V9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CcniQ9Z2V9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CcniQ9Z2V9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CcniQ9Z2V9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CcniQ9Z2V9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CcniQ9Z2V9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CcniQ9Z2V9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CcniQ9Z2V9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CcniQ9Z2V9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CcniQ9Z2V9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CcniQ9Z2V9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CcniQ9Z2V9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CcniQ9Z2V9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CcniQ9Z2V9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CcniQ9Z2V9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CcniQ9Z2V9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CcniQ9Z2V9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CcniQ9Z2V9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CcniQ9Z2V9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CcniQ9Z2V9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CcniQ9Z2V9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CcniQ9Z2V9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CcniQ9Z2V9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CcniQ9Z2V9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CcniQ9Z2V9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CcniQ9Z2V9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CcniQ9Z2V9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CcniQ9Z2V9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CcniQ9Z2V9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CcniQ9Z2V9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CcniQ9Z2V9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CcniQ9Z2V9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CcniQ9Z2V9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CcniQ9Z2V9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CcniQ9Z2V9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CcniQ9Z2V9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CcniQ9Z2V9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CcniQ9Z2V9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CcniQ9Z2V9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CcniQ9Z2V9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CcniQ9Z2V9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CcniQ9Z2V9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CcniQ9Z2V9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CcniQ9Z2V9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CcniQ9Z2V9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CcniQ9Z2V9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CcniQ9Z2V9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CcniQ9Z2V9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CcniQ9Z2V9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CcniQ9Z2V9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CcniQ9Z2V9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CcniQ9Z2V9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CcniQ9Z2V9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CcniQ9Z2V9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CcniQ9Z2V9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CcniQ9Z2V9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CcniQ9Z2V9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CcniQ9Z2V9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CcniQ9Z2V9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcniQ9Z2V9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcniQ9Z2V9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CcniQ9Z2V9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CcniQ9Z2V9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CcniQ9Z2V9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CcniQ9Z2V9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CcniQ9Z2V9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CcniQ9Z2V9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CcniQ9Z2V9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CcniQ9Z2V9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcniQ9Z2V9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CcniQ9Z2V9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CcniQ9Z2V9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CcniQ9Z2V9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CcniQ9Z2V9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CcniQ9Z2V9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CcniQ9Z2V9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CcniQ9Z2V9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CcniQ9Z2V9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CcniQ9Z2V9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CcniQ9Z2V9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CcniQ9Z2V9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcniQ9Z2V9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CcniQ9Z2V9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CcniQ9Z2V9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CcniQ9Z2V9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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