Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H6

Clec4d, C-type lectin domain family 4 member D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4dQ9Z2H6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Clec4dQ9Z2H6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Clec4dQ9Z2H6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clec4dQ9Z2H6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clec4dQ9Z2H6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clec4dQ9Z2H6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clec4dQ9Z2H6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clec4dQ9Z2H6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clec4dQ9Z2H6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clec4dQ9Z2H6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clec4dQ9Z2H6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clec4dQ9Z2H6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clec4dQ9Z2H6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clec4dQ9Z2H6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clec4dQ9Z2H6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clec4dQ9Z2H6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec4dQ9Z2H6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Clec4dQ9Z2H6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clec4dQ9Z2H6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clec4dQ9Z2H6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clec4dQ9Z2H6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clec4dQ9Z2H6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clec4dQ9Z2H6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec4dQ9Z2H6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clec4dQ9Z2H6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clec4dQ9Z2H6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clec4dQ9Z2H6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clec4dQ9Z2H6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4dQ9Z2H6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clec4dQ9Z2H6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Clec4dQ9Z2H6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec4dQ9Z2H6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec4dQ9Z2H6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec4dQ9Z2H6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clec4dQ9Z2H6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4dQ9Z2H6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4dQ9Z2H6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4dQ9Z2H6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4dQ9Z2H6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4dQ9Z2H6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4dQ9Z2H6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4dQ9Z2H6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4dQ9Z2H6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4dQ9Z2H6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4dQ9Z2H6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4dQ9Z2H6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4dQ9Z2H6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec4dQ9Z2H6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4dQ9Z2H6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec4dQ9Z2H6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4dQ9Z2H6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4dQ9Z2H6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4dQ9Z2H6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4dQ9Z2H6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4dQ9Z2H6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4dQ9Z2H6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4dQ9Z2H6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4dQ9Z2H6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4dQ9Z2H6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4dQ9Z2H6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec4dQ9Z2H6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4dQ9Z2H6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4dQ9Z2H6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4dQ9Z2H6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4dQ9Z2H6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4dQ9Z2H6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4dQ9Z2H6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4dQ9Z2H6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4dQ9Z2H6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4dQ9Z2H6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4dQ9Z2H6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4dQ9Z2H6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4dQ9Z2H6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4dQ9Z2H6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4dQ9Z2H6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec4dQ9Z2H6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clec4dQ9Z2H6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4dQ9Z2H6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4dQ9Z2H6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4dQ9Z2H6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4dQ9Z2H6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4dQ9Z2H6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4dQ9Z2H6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4dQ9Z2H6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4dQ9Z2H6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4dQ9Z2H6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4dQ9Z2H6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4dQ9Z2H6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4dQ9Z2H6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4dQ9Z2H6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec4dQ9Z2H6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec4dQ9Z2H6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4dQ9Z2H6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4dQ9Z2H6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4dQ9Z2H6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms