Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ap4s1Q9WVL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap4s1Q9WVL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap4s1Q9WVL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ap4s1Q9WVL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap4s1Q9WVL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ap4s1Q9WVL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap4s1Q9WVL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap4s1Q9WVL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap4s1Q9WVL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Ap4s1Q9WVL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap4s1Q9WVL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap4s1Q9WVL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap4s1Q9WVL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap4s1Q9WVL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap4s1Q9WVL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap4s1Q9WVL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap4s1Q9WVL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap4s1Q9WVL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap4s1Q9WVL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap4s1Q9WVL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap4s1Q9WVL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap4s1Q9WVL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap4s1Q9WVL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap4s1Q9WVL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap4s1Q9WVL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap4s1Q9WVL1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap4s1Q9WVL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap4s1Q9WVL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap4s1Q9WVL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap4s1Q9WVL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap4s1Q9WVL1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ap4s1Q9WVL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ap4s1Q9WVL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap4s1Q9WVL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap4s1Q9WVL1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap4s1Q9WVL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap4s1Q9WVL1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap4s1Q9WVL1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap4s1Q9WVL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ap4s1Q9WVL1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ap4s1Q9WVL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap4s1Q9WVL1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap4s1Q9WVL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap4s1Q9WVL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ap4s1Q9WVL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ap4s1Q9WVL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap4s1Q9WVL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap4s1Q9WVL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap4s1Q9WVL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap4s1Q9WVL1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap4s1Q9WVL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap4s1Q9WVL1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ap4s1Q9WVL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ap4s1Q9WVL1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap4s1Q9WVL1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ap4s1Q9WVL1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap4s1Q9WVL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap4s1Q9WVL1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap4s1Q9WVL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap4s1Q9WVL1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ap4s1Q9WVL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap4s1Q9WVL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ap4s1Q9WVL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ap4s1Q9WVL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ap4s1Q9WVL1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap4s1Q9WVL1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap4s1Q9WVL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap4s1Q9WVL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap4s1Q9WVL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap4s1Q9WVL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap4s1Q9WVL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap4s1Q9WVL1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap4s1Q9WVL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap4s1Q9WVL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ap4s1Q9WVL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap4s1Q9WVL1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap4s1Q9WVL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap4s1Q9WVL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap4s1Q9WVL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ap4s1Q9WVL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ap4s1Q9WVL1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap4s1Q9WVL1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ap4s1Q9WVL1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms