Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psma1Q9R1P4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psma1Q9R1P4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psma1Q9R1P4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Psma1Q9R1P4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Psma1Q9R1P4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psma1Q9R1P4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Psma1Q9R1P4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psma1Q9R1P4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psma1Q9R1P4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psma1Q9R1P4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psma1Q9R1P4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psma1Q9R1P4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psma1Q9R1P4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psma1Q9R1P4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psma1Q9R1P4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psma1Q9R1P4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psma1Q9R1P4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psma1Q9R1P4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psma1Q9R1P4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psma1Q9R1P4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Psma1Q9R1P4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psma1Q9R1P4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psma1Q9R1P4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psma1Q9R1P4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psma1Q9R1P4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psma1Q9R1P4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psma1Q9R1P4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psma1Q9R1P4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psma1Q9R1P4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Psma1Q9R1P4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psma1Q9R1P4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Psma1Q9R1P4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psma1Q9R1P4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psma1Q9R1P4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma1Q9R1P4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psma1Q9R1P4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma1Q9R1P4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma1Q9R1P4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma1Q9R1P4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma1Q9R1P4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma1Q9R1P4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma1Q9R1P4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma1Q9R1P4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma1Q9R1P4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma1Q9R1P4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma1Q9R1P4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma1Q9R1P4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psma1Q9R1P4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma1Q9R1P4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma1Q9R1P4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma1Q9R1P4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma1Q9R1P4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma1Q9R1P4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma1Q9R1P4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma1Q9R1P4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psma1Q9R1P4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma1Q9R1P4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psma1Q9R1P4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psma1Q9R1P4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psma1Q9R1P4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Psma1Q9R1P4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psma1Q9R1P4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psma1Q9R1P4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psma1Q9R1P4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psma1Q9R1P4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psma1Q9R1P4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psma1Q9R1P4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psma1Q9R1P4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psma1Q9R1P4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Psma1Q9R1P4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psma1Q9R1P4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psma1Q9R1P4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psma1Q9R1P4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psma1Q9R1P4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psma1Q9R1P4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psma1Q9R1P4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psma1Q9R1P4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psma1Q9R1P4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psma1Q9R1P4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psma1Q9R1P4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psma1Q9R1P4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psma1Q9R1P4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psma1Q9R1P4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psma1Q9R1P4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psma1Q9R1P4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma1Q9R1P4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psma1Q9R1P4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma1Q9R1P4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms