Protein–RNA interactions for Protein: Q9R190

Mta2, Metastasis-associated protein MTA2, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mta2Q9R190 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Mta2Q9R190 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Mta2Q9R190 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Mta2Q9R190 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Mta2Q9R190 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mta2Q9R190 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Mta2Q9R190 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Mta2Q9R190 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Mta2Q9R190 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Mta2Q9R190 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Mta2Q9R190 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Mta2Q9R190 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mta2Q9R190 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Mta2Q9R190 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mta2Q9R190 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Mta2Q9R190 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Mta2Q9R190 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Mta2Q9R190 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Mta2Q9R190 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Mta2Q9R190 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Mta2Q9R190 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Mta2Q9R190 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Mta2Q9R190 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Mta2Q9R190 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mta2Q9R190 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mta2Q9R190 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Mta2Q9R190 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Mta2Q9R190 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Mta2Q9R190 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Mta2Q9R190 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Mta2Q9R190 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Mta2Q9R190 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Mta2Q9R190 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Mta2Q9R190 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Mta2Q9R190 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mta2Q9R190 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mta2Q9R190 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Mta2Q9R190 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mta2Q9R190 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mta2Q9R190 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mta2Q9R190 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mta2Q9R190 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mta2Q9R190 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mta2Q9R190 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mta2Q9R190 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Mta2Q9R190 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mta2Q9R190 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mta2Q9R190 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mta2Q9R190 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mta2Q9R190 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Mta2Q9R190 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Mta2Q9R190 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mta2Q9R190 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Mta2Q9R190 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mta2Q9R190 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Mta2Q9R190 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mta2Q9R190 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Mta2Q9R190 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Mta2Q9R190 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Mta2Q9R190 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mta2Q9R190 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mta2Q9R190 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mta2Q9R190 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mta2Q9R190 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mta2Q9R190 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mta2Q9R190 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mta2Q9R190 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Mta2Q9R190 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mta2Q9R190 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Mta2Q9R190 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mta2Q9R190 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mta2Q9R190 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mta2Q9R190 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mta2Q9R190 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mta2Q9R190 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mta2Q9R190 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mta2Q9R190 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mta2Q9R190 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mta2Q9R190 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Mta2Q9R190 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mta2Q9R190 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mta2Q9R190 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mta2Q9R190 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mta2Q9R190 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Mta2Q9R190 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mta2Q9R190 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mta2Q9R190 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mta2Q9R190 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mta2Q9R190 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mta2Q9R190 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mta2Q9R190 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mta2Q9R190 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mta2Q9R190 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mta2Q9R190 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms