Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYJ1

St6galnac5, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St6galnac5Q9QYJ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
St6galnac5Q9QYJ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
St6galnac5Q9QYJ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
St6galnac5Q9QYJ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
St6galnac5Q9QYJ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
St6galnac5Q9QYJ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
St6galnac5Q9QYJ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
St6galnac5Q9QYJ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
St6galnac5Q9QYJ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
St6galnac5Q9QYJ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
St6galnac5Q9QYJ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
St6galnac5Q9QYJ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
St6galnac5Q9QYJ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
St6galnac5Q9QYJ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
St6galnac5Q9QYJ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
St6galnac5Q9QYJ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
St6galnac5Q9QYJ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
St6galnac5Q9QYJ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
St6galnac5Q9QYJ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
St6galnac5Q9QYJ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
St6galnac5Q9QYJ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
St6galnac5Q9QYJ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
St6galnac5Q9QYJ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
St6galnac5Q9QYJ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
St6galnac5Q9QYJ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
St6galnac5Q9QYJ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
St6galnac5Q9QYJ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
St6galnac5Q9QYJ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
St6galnac5Q9QYJ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
St6galnac5Q9QYJ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
St6galnac5Q9QYJ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
St6galnac5Q9QYJ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
St6galnac5Q9QYJ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
St6galnac5Q9QYJ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
St6galnac5Q9QYJ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
St6galnac5Q9QYJ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
St6galnac5Q9QYJ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
St6galnac5Q9QYJ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
St6galnac5Q9QYJ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
St6galnac5Q9QYJ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
St6galnac5Q9QYJ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
St6galnac5Q9QYJ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
St6galnac5Q9QYJ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
St6galnac5Q9QYJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
St6galnac5Q9QYJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
St6galnac5Q9QYJ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St6galnac5Q9QYJ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
St6galnac5Q9QYJ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
St6galnac5Q9QYJ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
St6galnac5Q9QYJ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
St6galnac5Q9QYJ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
St6galnac5Q9QYJ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St6galnac5Q9QYJ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St6galnac5Q9QYJ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St6galnac5Q9QYJ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
St6galnac5Q9QYJ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
St6galnac5Q9QYJ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
St6galnac5Q9QYJ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
St6galnac5Q9QYJ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
St6galnac5Q9QYJ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
St6galnac5Q9QYJ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
St6galnac5Q9QYJ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
St6galnac5Q9QYJ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
St6galnac5Q9QYJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
St6galnac5Q9QYJ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
St6galnac5Q9QYJ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
St6galnac5Q9QYJ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
St6galnac5Q9QYJ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
St6galnac5Q9QYJ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
St6galnac5Q9QYJ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
St6galnac5Q9QYJ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
St6galnac5Q9QYJ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
St6galnac5Q9QYJ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
St6galnac5Q9QYJ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
St6galnac5Q9QYJ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
St6galnac5Q9QYJ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
St6galnac5Q9QYJ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St6galnac5Q9QYJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St6galnac5Q9QYJ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St6galnac5Q9QYJ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
St6galnac5Q9QYJ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
St6galnac5Q9QYJ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
St6galnac5Q9QYJ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
St6galnac5Q9QYJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
St6galnac5Q9QYJ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
St6galnac5Q9QYJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
St6galnac5Q9QYJ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
St6galnac5Q9QYJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
St6galnac5Q9QYJ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
St6galnac5Q9QYJ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
St6galnac5Q9QYJ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
St6galnac5Q9QYJ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
St6galnac5Q9QYJ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
St6galnac5Q9QYJ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
St6galnac5Q9QYJ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms