Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Copg2Q9QXK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Copg2Q9QXK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Copg2Q9QXK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Copg2Q9QXK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Copg2Q9QXK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Copg2Q9QXK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Copg2Q9QXK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Copg2Q9QXK3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Copg2Q9QXK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Copg2Q9QXK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Copg2Q9QXK3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Copg2Q9QXK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Copg2Q9QXK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Copg2Q9QXK3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Copg2Q9QXK3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Copg2Q9QXK3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Copg2Q9QXK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Copg2Q9QXK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Copg2Q9QXK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Copg2Q9QXK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Copg2Q9QXK3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Copg2Q9QXK3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Copg2Q9QXK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Copg2Q9QXK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Copg2Q9QXK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Copg2Q9QXK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Copg2Q9QXK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Copg2Q9QXK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Copg2Q9QXK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Copg2Q9QXK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Copg2Q9QXK3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Copg2Q9QXK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Copg2Q9QXK3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Copg2Q9QXK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Copg2Q9QXK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Copg2Q9QXK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Copg2Q9QXK3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Copg2Q9QXK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Copg2Q9QXK3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Copg2Q9QXK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Copg2Q9QXK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Copg2Q9QXK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Copg2Q9QXK3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Copg2Q9QXK3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Copg2Q9QXK3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Copg2Q9QXK3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Copg2Q9QXK3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Copg2Q9QXK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Copg2Q9QXK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Copg2Q9QXK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Copg2Q9QXK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Copg2Q9QXK3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Copg2Q9QXK3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Copg2Q9QXK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Copg2Q9QXK3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Copg2Q9QXK3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Copg2Q9QXK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Copg2Q9QXK3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Copg2Q9QXK3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Copg2Q9QXK3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Copg2Q9QXK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Copg2Q9QXK3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Copg2Q9QXK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Copg2Q9QXK3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Copg2Q9QXK3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Copg2Q9QXK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Copg2Q9QXK3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Copg2Q9QXK3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Copg2Q9QXK3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Copg2Q9QXK3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Copg2Q9QXK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copg2Q9QXK3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copg2Q9QXK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Copg2Q9QXK3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Copg2Q9QXK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Copg2Q9QXK3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Copg2Q9QXK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Copg2Q9QXK3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Copg2Q9QXK3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Copg2Q9QXK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Copg2Q9QXK3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Copg2Q9QXK3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Copg2Q9QXK3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Copg2Q9QXK3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Copg2Q9QXK3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Copg2Q9QXK3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Copg2Q9QXK3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Copg2Q9QXK3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Copg2Q9QXK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Copg2Q9QXK3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Copg2Q9QXK3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Copg2Q9QXK3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Copg2Q9QXK3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms