Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Cul3Q9JLV5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cul3Q9JLV5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cul3Q9JLV5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cul3Q9JLV5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cul3Q9JLV5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cul3Q9JLV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cul3Q9JLV5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cul3Q9JLV5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cul3Q9JLV5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Cul3Q9JLV5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cul3Q9JLV5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cul3Q9JLV5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul3Q9JLV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cul3Q9JLV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cul3Q9JLV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cul3Q9JLV5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cul3Q9JLV5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cul3Q9JLV5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cul3Q9JLV5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cul3Q9JLV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul3Q9JLV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cul3Q9JLV5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul3Q9JLV5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul3Q9JLV5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul3Q9JLV5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul3Q9JLV5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul3Q9JLV5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul3Q9JLV5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cul3Q9JLV5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul3Q9JLV5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul3Q9JLV5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul3Q9JLV5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul3Q9JLV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul3Q9JLV5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul3Q9JLV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul3Q9JLV5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul3Q9JLV5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul3Q9JLV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul3Q9JLV5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul3Q9JLV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul3Q9JLV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul3Q9JLV5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul3Q9JLV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul3Q9JLV5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul3Q9JLV5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul3Q9JLV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul3Q9JLV5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cul3Q9JLV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cul3Q9JLV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul3Q9JLV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul3Q9JLV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul3Q9JLV5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul3Q9JLV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul3Q9JLV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul3Q9JLV5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul3Q9JLV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cul3Q9JLV5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul3Q9JLV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul3Q9JLV5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul3Q9JLV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul3Q9JLV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul3Q9JLV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul3Q9JLV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul3Q9JLV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul3Q9JLV5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul3Q9JLV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul3Q9JLV5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul3Q9JLV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul3Q9JLV5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul3Q9JLV5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul3Q9JLV5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul3Q9JLV5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul3Q9JLV5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul3Q9JLV5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul3Q9JLV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul3Q9JLV5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul3Q9JLV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul3Q9JLV5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul3Q9JLV5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cul3Q9JLV5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul3Q9JLV5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul3Q9JLV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul3Q9JLV5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul3Q9JLV5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul3Q9JLV5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul3Q9JLV5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul3Q9JLV5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul3Q9JLV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul3Q9JLV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul3Q9JLV5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul3Q9JLV5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul3Q9JLV5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul3Q9JLV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms