Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL89

Ninj2, Ninjurin-2, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ninj2Q9JL89 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ninj2Q9JL89 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ninj2Q9JL89 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ninj2Q9JL89 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ninj2Q9JL89 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ninj2Q9JL89 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ninj2Q9JL89 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ninj2Q9JL89 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ninj2Q9JL89 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ninj2Q9JL89 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ninj2Q9JL89 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ninj2Q9JL89 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ninj2Q9JL89 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ninj2Q9JL89 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ninj2Q9JL89 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ninj2Q9JL89 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ninj2Q9JL89 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ninj2Q9JL89 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ninj2Q9JL89 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ninj2Q9JL89 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ninj2Q9JL89 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ninj2Q9JL89 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ninj2Q9JL89 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ninj2Q9JL89 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ninj2Q9JL89 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ninj2Q9JL89 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ninj2Q9JL89 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ninj2Q9JL89 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ninj2Q9JL89 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ninj2Q9JL89 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ninj2Q9JL89 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ninj2Q9JL89 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ninj2Q9JL89 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ninj2Q9JL89 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ninj2Q9JL89 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ninj2Q9JL89 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ninj2Q9JL89 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ninj2Q9JL89 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ninj2Q9JL89 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ninj2Q9JL89 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ninj2Q9JL89 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ninj2Q9JL89 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ninj2Q9JL89 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ninj2Q9JL89 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ninj2Q9JL89 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ninj2Q9JL89 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ninj2Q9JL89 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ninj2Q9JL89 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ninj2Q9JL89 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ninj2Q9JL89 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ninj2Q9JL89 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ninj2Q9JL89 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ninj2Q9JL89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ninj2Q9JL89 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ninj2Q9JL89 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ninj2Q9JL89 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ninj2Q9JL89 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ninj2Q9JL89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ninj2Q9JL89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ninj2Q9JL89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ninj2Q9JL89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ninj2Q9JL89 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ninj2Q9JL89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ninj2Q9JL89 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ninj2Q9JL89 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ninj2Q9JL89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ninj2Q9JL89 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ninj2Q9JL89 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ninj2Q9JL89 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ninj2Q9JL89 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ninj2Q9JL89 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ninj2Q9JL89 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ninj2Q9JL89 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ninj2Q9JL89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ninj2Q9JL89 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ninj2Q9JL89 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ninj2Q9JL89 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ninj2Q9JL89 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ninj2Q9JL89 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ninj2Q9JL89 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ninj2Q9JL89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ninj2Q9JL89 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ninj2Q9JL89 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ninj2Q9JL89 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ninj2Q9JL89 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ninj2Q9JL89 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ninj2Q9JL89 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ninj2Q9JL89 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ninj2Q9JL89 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ninj2Q9JL89 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ninj2Q9JL89 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ninj2Q9JL89 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ninj2Q9JL89 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ninj2Q9JL89 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ninj2Q9JL89 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ninj2Q9JL89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ninj2Q9JL89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ninj2Q9JL89 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ninj2Q9JL89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ninj2Q9JL89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms