Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI33

Ntn4, Netrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn4Q9JI33 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ntn4Q9JI33 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ntn4Q9JI33 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ntn4Q9JI33 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ntn4Q9JI33 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ntn4Q9JI33 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ntn4Q9JI33 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ntn4Q9JI33 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ntn4Q9JI33 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ntn4Q9JI33 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ntn4Q9JI33 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ntn4Q9JI33 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ntn4Q9JI33 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ntn4Q9JI33 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ntn4Q9JI33 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ntn4Q9JI33 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ntn4Q9JI33 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ntn4Q9JI33 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ntn4Q9JI33 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ntn4Q9JI33 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ntn4Q9JI33 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ntn4Q9JI33 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ntn4Q9JI33 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ntn4Q9JI33 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ntn4Q9JI33 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ntn4Q9JI33 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ntn4Q9JI33 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ntn4Q9JI33 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ntn4Q9JI33 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ntn4Q9JI33 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ntn4Q9JI33 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ntn4Q9JI33 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ntn4Q9JI33 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ntn4Q9JI33 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ntn4Q9JI33 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ntn4Q9JI33 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ntn4Q9JI33 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ntn4Q9JI33 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ntn4Q9JI33 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ntn4Q9JI33 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ntn4Q9JI33 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ntn4Q9JI33 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ntn4Q9JI33 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ntn4Q9JI33 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ntn4Q9JI33 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ntn4Q9JI33 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ntn4Q9JI33 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ntn4Q9JI33 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ntn4Q9JI33 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ntn4Q9JI33 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ntn4Q9JI33 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ntn4Q9JI33 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ntn4Q9JI33 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ntn4Q9JI33 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ntn4Q9JI33 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ntn4Q9JI33 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ntn4Q9JI33 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ntn4Q9JI33 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ntn4Q9JI33 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ntn4Q9JI33 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ntn4Q9JI33 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ntn4Q9JI33 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ntn4Q9JI33 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ntn4Q9JI33 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ntn4Q9JI33 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ntn4Q9JI33 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ntn4Q9JI33 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ntn4Q9JI33 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ntn4Q9JI33 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ntn4Q9JI33 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ntn4Q9JI33 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ntn4Q9JI33 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ntn4Q9JI33 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ntn4Q9JI33 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ntn4Q9JI33 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ntn4Q9JI33 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ntn4Q9JI33 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ntn4Q9JI33 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ntn4Q9JI33 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ntn4Q9JI33 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ntn4Q9JI33 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ntn4Q9JI33 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ntn4Q9JI33 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ntn4Q9JI33 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ntn4Q9JI33 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ntn4Q9JI33 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ntn4Q9JI33 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ntn4Q9JI33 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ntn4Q9JI33 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ntn4Q9JI33 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ntn4Q9JI33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ntn4Q9JI33 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ntn4Q9JI33 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ntn4Q9JI33 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ntn4Q9JI33 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ntn4Q9JI33 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ntn4Q9JI33 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ntn4Q9JI33 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ntn4Q9JI33 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ntn4Q9JI33 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms