Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ClpxQ9JHS4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ClpxQ9JHS4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ClpxQ9JHS4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ClpxQ9JHS4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ClpxQ9JHS4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ClpxQ9JHS4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ClpxQ9JHS4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ClpxQ9JHS4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ClpxQ9JHS4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ClpxQ9JHS4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ClpxQ9JHS4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ClpxQ9JHS4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ClpxQ9JHS4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ClpxQ9JHS4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClpxQ9JHS4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ClpxQ9JHS4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ClpxQ9JHS4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ClpxQ9JHS4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ClpxQ9JHS4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ClpxQ9JHS4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ClpxQ9JHS4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ClpxQ9JHS4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ClpxQ9JHS4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ClpxQ9JHS4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClpxQ9JHS4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClpxQ9JHS4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClpxQ9JHS4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClpxQ9JHS4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ClpxQ9JHS4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ClpxQ9JHS4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ClpxQ9JHS4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ClpxQ9JHS4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClpxQ9JHS4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ClpxQ9JHS4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ClpxQ9JHS4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ClpxQ9JHS4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ClpxQ9JHS4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ClpxQ9JHS4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ClpxQ9JHS4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ClpxQ9JHS4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ClpxQ9JHS4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ClpxQ9JHS4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ClpxQ9JHS4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClpxQ9JHS4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClpxQ9JHS4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClpxQ9JHS4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ClpxQ9JHS4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClpxQ9JHS4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ClpxQ9JHS4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClpxQ9JHS4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ClpxQ9JHS4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ClpxQ9JHS4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClpxQ9JHS4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ClpxQ9JHS4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClpxQ9JHS4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ClpxQ9JHS4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ClpxQ9JHS4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ClpxQ9JHS4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClpxQ9JHS4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClpxQ9JHS4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClpxQ9JHS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClpxQ9JHS4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ClpxQ9JHS4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ClpxQ9JHS4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClpxQ9JHS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClpxQ9JHS4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClpxQ9JHS4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ClpxQ9JHS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClpxQ9JHS4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClpxQ9JHS4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClpxQ9JHS4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClpxQ9JHS4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClpxQ9JHS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClpxQ9JHS4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClpxQ9JHS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClpxQ9JHS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClpxQ9JHS4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClpxQ9JHS4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClpxQ9JHS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ClpxQ9JHS4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClpxQ9JHS4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClpxQ9JHS4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ClpxQ9JHS4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClpxQ9JHS4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ClpxQ9JHS4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ClpxQ9JHS4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClpxQ9JHS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClpxQ9JHS4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClpxQ9JHS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ClpxQ9JHS4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClpxQ9JHS4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ClpxQ9JHS4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClpxQ9JHS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ClpxQ9JHS4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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