Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmem27Q9ESG4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmem27Q9ESG4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmem27Q9ESG4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmem27Q9ESG4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmem27Q9ESG4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmem27Q9ESG4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tmem27Q9ESG4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem27Q9ESG4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem27Q9ESG4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem27Q9ESG4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem27Q9ESG4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem27Q9ESG4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem27Q9ESG4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem27Q9ESG4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem27Q9ESG4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem27Q9ESG4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem27Q9ESG4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem27Q9ESG4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tmem27Q9ESG4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem27Q9ESG4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tmem27Q9ESG4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem27Q9ESG4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem27Q9ESG4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem27Q9ESG4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem27Q9ESG4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem27Q9ESG4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem27Q9ESG4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem27Q9ESG4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmem27Q9ESG4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem27Q9ESG4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem27Q9ESG4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem27Q9ESG4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem27Q9ESG4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem27Q9ESG4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem27Q9ESG4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmem27Q9ESG4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmem27Q9ESG4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem27Q9ESG4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem27Q9ESG4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem27Q9ESG4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem27Q9ESG4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem27Q9ESG4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem27Q9ESG4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmem27Q9ESG4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem27Q9ESG4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmem27Q9ESG4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem27Q9ESG4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem27Q9ESG4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem27Q9ESG4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem27Q9ESG4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem27Q9ESG4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem27Q9ESG4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem27Q9ESG4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem27Q9ESG4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem27Q9ESG4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem27Q9ESG4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem27Q9ESG4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem27Q9ESG4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem27Q9ESG4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem27Q9ESG4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem27Q9ESG4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem27Q9ESG4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem27Q9ESG4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem27Q9ESG4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem27Q9ESG4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem27Q9ESG4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem27Q9ESG4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem27Q9ESG4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem27Q9ESG4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem27Q9ESG4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem27Q9ESG4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem27Q9ESG4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem27Q9ESG4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem27Q9ESG4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem27Q9ESG4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem27Q9ESG4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem27Q9ESG4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem27Q9ESG4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem27Q9ESG4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem27Q9ESG4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem27Q9ESG4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem27Q9ESG4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem27Q9ESG4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem27Q9ESG4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem27Q9ESG4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem27Q9ESG4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem27Q9ESG4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem27Q9ESG4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem27Q9ESG4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem27Q9ESG4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem27Q9ESG4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem27Q9ESG4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem27Q9ESG4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem27Q9ESG4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem27Q9ESG4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem27Q9ESG4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem27Q9ESG4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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