Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Nek6Q9ES70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nek6Q9ES70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nek6Q9ES70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek6Q9ES70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek6Q9ES70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nek6Q9ES70 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek6Q9ES70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek6Q9ES70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek6Q9ES70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek6Q9ES70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek6Q9ES70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek6Q9ES70 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek6Q9ES70 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek6Q9ES70 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek6Q9ES70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek6Q9ES70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek6Q9ES70 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek6Q9ES70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nek6Q9ES70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nek6Q9ES70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nek6Q9ES70 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nek6Q9ES70 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nek6Q9ES70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nek6Q9ES70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nek6Q9ES70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek6Q9ES70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek6Q9ES70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nek6Q9ES70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nek6Q9ES70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nek6Q9ES70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nek6Q9ES70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek6Q9ES70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek6Q9ES70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek6Q9ES70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek6Q9ES70 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek6Q9ES70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek6Q9ES70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek6Q9ES70 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nek6Q9ES70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nek6Q9ES70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek6Q9ES70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek6Q9ES70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek6Q9ES70 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek6Q9ES70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek6Q9ES70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek6Q9ES70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek6Q9ES70 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek6Q9ES70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek6Q9ES70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek6Q9ES70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek6Q9ES70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek6Q9ES70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek6Q9ES70 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek6Q9ES70 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek6Q9ES70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek6Q9ES70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek6Q9ES70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek6Q9ES70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek6Q9ES70 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek6Q9ES70 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek6Q9ES70 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek6Q9ES70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek6Q9ES70 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek6Q9ES70 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek6Q9ES70 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek6Q9ES70 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek6Q9ES70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek6Q9ES70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek6Q9ES70 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek6Q9ES70 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek6Q9ES70 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek6Q9ES70 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek6Q9ES70 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek6Q9ES70 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek6Q9ES70 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek6Q9ES70 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek6Q9ES70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek6Q9ES70 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek6Q9ES70 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek6Q9ES70 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek6Q9ES70 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek6Q9ES70 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek6Q9ES70 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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