Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ4

Chrm2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm2Q9ERZ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Chrm2Q9ERZ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chrm2Q9ERZ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrm2Q9ERZ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chrm2Q9ERZ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chrm2Q9ERZ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrm2Q9ERZ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Chrm2Q9ERZ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrm2Q9ERZ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrm2Q9ERZ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrm2Q9ERZ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrm2Q9ERZ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrm2Q9ERZ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrm2Q9ERZ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrm2Q9ERZ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrm2Q9ERZ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrm2Q9ERZ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chrm2Q9ERZ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrm2Q9ERZ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrm2Q9ERZ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chrm2Q9ERZ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrm2Q9ERZ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chrm2Q9ERZ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chrm2Q9ERZ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chrm2Q9ERZ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrm2Q9ERZ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrm2Q9ERZ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrm2Q9ERZ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrm2Q9ERZ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrm2Q9ERZ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrm2Q9ERZ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chrm2Q9ERZ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrm2Q9ERZ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrm2Q9ERZ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrm2Q9ERZ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrm2Q9ERZ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrm2Q9ERZ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrm2Q9ERZ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrm2Q9ERZ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrm2Q9ERZ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrm2Q9ERZ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrm2Q9ERZ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrm2Q9ERZ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrm2Q9ERZ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrm2Q9ERZ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrm2Q9ERZ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm2Q9ERZ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrm2Q9ERZ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrm2Q9ERZ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrm2Q9ERZ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm2Q9ERZ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrm2Q9ERZ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrm2Q9ERZ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrm2Q9ERZ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrm2Q9ERZ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm2Q9ERZ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm2Q9ERZ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrm2Q9ERZ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrm2Q9ERZ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrm2Q9ERZ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrm2Q9ERZ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrm2Q9ERZ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrm2Q9ERZ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrm2Q9ERZ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrm2Q9ERZ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chrm2Q9ERZ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrm2Q9ERZ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrm2Q9ERZ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm2Q9ERZ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm2Q9ERZ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm2Q9ERZ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrm2Q9ERZ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrm2Q9ERZ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm2Q9ERZ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm2Q9ERZ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm2Q9ERZ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm2Q9ERZ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm2Q9ERZ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm2Q9ERZ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrm2Q9ERZ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm2Q9ERZ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrm2Q9ERZ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrm2Q9ERZ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrm2Q9ERZ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chrm2Q9ERZ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrm2Q9ERZ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm2Q9ERZ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrm2Q9ERZ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm2Q9ERZ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm2Q9ERZ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm2Q9ERZ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm2Q9ERZ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm2Q9ERZ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm2Q9ERZ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrm2Q9ERZ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm2Q9ERZ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm2Q9ERZ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm2Q9ERZ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm2Q9ERZ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm2Q9ERZ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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