Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERL9

Gucy1a3, Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gucy1a3Q9ERL9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Gucy1a3Q9ERL9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gucy1a3Q9ERL9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Gucy1a3Q9ERL9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gucy1a3Q9ERL9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gucy1a3Q9ERL9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gucy1a3Q9ERL9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gucy1a3Q9ERL9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Gucy1a3Q9ERL9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gucy1a3Q9ERL9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gucy1a3Q9ERL9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Gucy1a3Q9ERL9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gucy1a3Q9ERL9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gucy1a3Q9ERL9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Gucy1a3Q9ERL9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Gucy1a3Q9ERL9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gucy1a3Q9ERL9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gucy1a3Q9ERL9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gucy1a3Q9ERL9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gucy1a3Q9ERL9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gucy1a3Q9ERL9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gucy1a3Q9ERL9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gucy1a3Q9ERL9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gucy1a3Q9ERL9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gucy1a3Q9ERL9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gucy1a3Q9ERL9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gucy1a3Q9ERL9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gucy1a3Q9ERL9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gucy1a3Q9ERL9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gucy1a3Q9ERL9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gucy1a3Q9ERL9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gucy1a3Q9ERL9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gucy1a3Q9ERL9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gucy1a3Q9ERL9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gucy1a3Q9ERL9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gucy1a3Q9ERL9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gucy1a3Q9ERL9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gucy1a3Q9ERL9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gucy1a3Q9ERL9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gucy1a3Q9ERL9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Gucy1a3Q9ERL9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gucy1a3Q9ERL9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gucy1a3Q9ERL9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gucy1a3Q9ERL9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gucy1a3Q9ERL9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gucy1a3Q9ERL9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gucy1a3Q9ERL9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gucy1a3Q9ERL9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gucy1a3Q9ERL9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gucy1a3Q9ERL9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gucy1a3Q9ERL9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gucy1a3Q9ERL9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gucy1a3Q9ERL9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gucy1a3Q9ERL9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gucy1a3Q9ERL9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gucy1a3Q9ERL9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gucy1a3Q9ERL9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gucy1a3Q9ERL9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gucy1a3Q9ERL9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gucy1a3Q9ERL9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gucy1a3Q9ERL9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gucy1a3Q9ERL9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gucy1a3Q9ERL9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gucy1a3Q9ERL9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gucy1a3Q9ERL9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gucy1a3Q9ERL9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gucy1a3Q9ERL9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gucy1a3Q9ERL9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gucy1a3Q9ERL9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gucy1a3Q9ERL9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gucy1a3Q9ERL9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gucy1a3Q9ERL9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gucy1a3Q9ERL9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gucy1a3Q9ERL9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gucy1a3Q9ERL9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gucy1a3Q9ERL9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gucy1a3Q9ERL9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gucy1a3Q9ERL9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gucy1a3Q9ERL9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gucy1a3Q9ERL9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gucy1a3Q9ERL9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gucy1a3Q9ERL9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gucy1a3Q9ERL9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gucy1a3Q9ERL9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gucy1a3Q9ERL9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gucy1a3Q9ERL9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gucy1a3Q9ERL9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gucy1a3Q9ERL9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gucy1a3Q9ERL9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gucy1a3Q9ERL9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gucy1a3Q9ERL9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gucy1a3Q9ERL9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gucy1a3Q9ERL9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gucy1a3Q9ERL9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gucy1a3Q9ERL9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gucy1a3Q9ERL9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gucy1a3Q9ERL9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gucy1a3Q9ERL9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gucy1a3Q9ERL9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gucy1a3Q9ERL9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms