Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV5

Psg21, MCG140256, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg21Q9DAV5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Psg21Q9DAV5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Psg21Q9DAV5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Psg21Q9DAV5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Psg21Q9DAV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Psg21Q9DAV5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Psg21Q9DAV5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Psg21Q9DAV5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psg21Q9DAV5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psg21Q9DAV5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psg21Q9DAV5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psg21Q9DAV5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psg21Q9DAV5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Psg21Q9DAV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psg21Q9DAV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psg21Q9DAV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psg21Q9DAV5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Psg21Q9DAV5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Psg21Q9DAV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psg21Q9DAV5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psg21Q9DAV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Psg21Q9DAV5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psg21Q9DAV5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psg21Q9DAV5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psg21Q9DAV5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Psg21Q9DAV5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psg21Q9DAV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psg21Q9DAV5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psg21Q9DAV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Psg21Q9DAV5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psg21Q9DAV5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psg21Q9DAV5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psg21Q9DAV5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psg21Q9DAV5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psg21Q9DAV5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psg21Q9DAV5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psg21Q9DAV5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Psg21Q9DAV5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psg21Q9DAV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Psg21Q9DAV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psg21Q9DAV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psg21Q9DAV5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psg21Q9DAV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psg21Q9DAV5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psg21Q9DAV5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psg21Q9DAV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psg21Q9DAV5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Psg21Q9DAV5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Psg21Q9DAV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Psg21Q9DAV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psg21Q9DAV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Psg21Q9DAV5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psg21Q9DAV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Psg21Q9DAV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psg21Q9DAV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Psg21Q9DAV5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psg21Q9DAV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Psg21Q9DAV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psg21Q9DAV5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Psg21Q9DAV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psg21Q9DAV5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Psg21Q9DAV5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Psg21Q9DAV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Psg21Q9DAV5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Psg21Q9DAV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psg21Q9DAV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psg21Q9DAV5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psg21Q9DAV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Psg21Q9DAV5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psg21Q9DAV5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psg21Q9DAV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Psg21Q9DAV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psg21Q9DAV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psg21Q9DAV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psg21Q9DAV5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psg21Q9DAV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psg21Q9DAV5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psg21Q9DAV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psg21Q9DAV5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psg21Q9DAV5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psg21Q9DAV5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psg21Q9DAV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psg21Q9DAV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psg21Q9DAV5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psg21Q9DAV5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psg21Q9DAV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psg21Q9DAV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psg21Q9DAV5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psg21Q9DAV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psg21Q9DAV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Psg21Q9DAV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psg21Q9DAV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psg21Q9DAV5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psg21Q9DAV5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psg21Q9DAV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psg21Q9DAV5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psg21Q9DAV5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psg21Q9DAV5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Psg21Q9DAV5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psg21Q9DAV5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms