Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA32

Sun5, SUN domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun5Q9DA32 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Sun5Q9DA32 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sun5Q9DA32 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sun5Q9DA32 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sun5Q9DA32 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sun5Q9DA32 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sun5Q9DA32 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sun5Q9DA32 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sun5Q9DA32 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sun5Q9DA32 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sun5Q9DA32 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sun5Q9DA32 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sun5Q9DA32 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sun5Q9DA32 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sun5Q9DA32 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sun5Q9DA32 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sun5Q9DA32 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sun5Q9DA32 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sun5Q9DA32 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sun5Q9DA32 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sun5Q9DA32 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sun5Q9DA32 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sun5Q9DA32 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sun5Q9DA32 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sun5Q9DA32 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sun5Q9DA32 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sun5Q9DA32 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sun5Q9DA32 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sun5Q9DA32 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sun5Q9DA32 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sun5Q9DA32 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sun5Q9DA32 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sun5Q9DA32 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sun5Q9DA32 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sun5Q9DA32 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sun5Q9DA32 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sun5Q9DA32 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sun5Q9DA32 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sun5Q9DA32 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sun5Q9DA32 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sun5Q9DA32 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sun5Q9DA32 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sun5Q9DA32 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sun5Q9DA32 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sun5Q9DA32 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sun5Q9DA32 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sun5Q9DA32 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sun5Q9DA32 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sun5Q9DA32 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sun5Q9DA32 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sun5Q9DA32 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sun5Q9DA32 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sun5Q9DA32 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sun5Q9DA32 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sun5Q9DA32 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sun5Q9DA32 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sun5Q9DA32 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sun5Q9DA32 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sun5Q9DA32 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sun5Q9DA32 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun5Q9DA32 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sun5Q9DA32 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun5Q9DA32 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sun5Q9DA32 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sun5Q9DA32 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun5Q9DA32 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sun5Q9DA32 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sun5Q9DA32 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sun5Q9DA32 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sun5Q9DA32 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sun5Q9DA32 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sun5Q9DA32 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sun5Q9DA32 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sun5Q9DA32 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sun5Q9DA32 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sun5Q9DA32 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sun5Q9DA32 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sun5Q9DA32 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sun5Q9DA32 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sun5Q9DA32 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sun5Q9DA32 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sun5Q9DA32 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sun5Q9DA32 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sun5Q9DA32 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sun5Q9DA32 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sun5Q9DA32 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sun5Q9DA32 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sun5Q9DA32 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sun5Q9DA32 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sun5Q9DA32 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sun5Q9DA32 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sun5Q9DA32 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sun5Q9DA32 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sun5Q9DA32 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sun5Q9DA32 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms