Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9K8

Iqcf1, IQ domain-containing protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf1Q9D9K8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Iqcf1Q9D9K8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Iqcf1Q9D9K8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Iqcf1Q9D9K8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Iqcf1Q9D9K8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Iqcf1Q9D9K8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Iqcf1Q9D9K8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Iqcf1Q9D9K8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Iqcf1Q9D9K8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Iqcf1Q9D9K8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Iqcf1Q9D9K8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Iqcf1Q9D9K8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Iqcf1Q9D9K8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Iqcf1Q9D9K8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Iqcf1Q9D9K8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Iqcf1Q9D9K8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Iqcf1Q9D9K8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Iqcf1Q9D9K8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Iqcf1Q9D9K8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Iqcf1Q9D9K8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Iqcf1Q9D9K8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Iqcf1Q9D9K8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Iqcf1Q9D9K8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Iqcf1Q9D9K8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Iqcf1Q9D9K8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Iqcf1Q9D9K8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Iqcf1Q9D9K8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Iqcf1Q9D9K8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Iqcf1Q9D9K8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Iqcf1Q9D9K8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Iqcf1Q9D9K8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Iqcf1Q9D9K8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf1Q9D9K8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Iqcf1Q9D9K8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Iqcf1Q9D9K8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Iqcf1Q9D9K8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Iqcf1Q9D9K8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Iqcf1Q9D9K8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Iqcf1Q9D9K8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Iqcf1Q9D9K8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Iqcf1Q9D9K8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Iqcf1Q9D9K8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Iqcf1Q9D9K8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Iqcf1Q9D9K8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Iqcf1Q9D9K8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Iqcf1Q9D9K8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Iqcf1Q9D9K8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Iqcf1Q9D9K8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Iqcf1Q9D9K8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Iqcf1Q9D9K8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Iqcf1Q9D9K8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Iqcf1Q9D9K8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Iqcf1Q9D9K8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Iqcf1Q9D9K8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Iqcf1Q9D9K8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Iqcf1Q9D9K8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Iqcf1Q9D9K8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Iqcf1Q9D9K8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Iqcf1Q9D9K8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Iqcf1Q9D9K8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Iqcf1Q9D9K8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Iqcf1Q9D9K8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Iqcf1Q9D9K8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Iqcf1Q9D9K8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Iqcf1Q9D9K8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Iqcf1Q9D9K8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Iqcf1Q9D9K8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Iqcf1Q9D9K8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Iqcf1Q9D9K8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Iqcf1Q9D9K8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Iqcf1Q9D9K8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Iqcf1Q9D9K8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Iqcf1Q9D9K8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Iqcf1Q9D9K8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Iqcf1Q9D9K8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Iqcf1Q9D9K8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Iqcf1Q9D9K8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Iqcf1Q9D9K8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Iqcf1Q9D9K8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Iqcf1Q9D9K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Iqcf1Q9D9K8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Iqcf1Q9D9K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Iqcf1Q9D9K8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Iqcf1Q9D9K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Iqcf1Q9D9K8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Iqcf1Q9D9K8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Iqcf1Q9D9K8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Iqcf1Q9D9K8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Iqcf1Q9D9K8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Iqcf1Q9D9K8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Iqcf1Q9D9K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Iqcf1Q9D9K8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Iqcf1Q9D9K8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Iqcf1Q9D9K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Iqcf1Q9D9K8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Iqcf1Q9D9K8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Iqcf1Q9D9K8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms