Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M1

Gid8, Glucose-induced degradation protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gid8Q9D7M1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gid8Q9D7M1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Gid8Q9D7M1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gid8Q9D7M1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gid8Q9D7M1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Gid8Q9D7M1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gid8Q9D7M1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gid8Q9D7M1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gid8Q9D7M1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gid8Q9D7M1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gid8Q9D7M1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gid8Q9D7M1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gid8Q9D7M1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gid8Q9D7M1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gid8Q9D7M1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gid8Q9D7M1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gid8Q9D7M1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Gid8Q9D7M1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gid8Q9D7M1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gid8Q9D7M1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gid8Q9D7M1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Gid8Q9D7M1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gid8Q9D7M1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gid8Q9D7M1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gid8Q9D7M1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gid8Q9D7M1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gid8Q9D7M1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gid8Q9D7M1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gid8Q9D7M1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gid8Q9D7M1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gid8Q9D7M1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gid8Q9D7M1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gid8Q9D7M1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gid8Q9D7M1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gid8Q9D7M1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gid8Q9D7M1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gid8Q9D7M1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gid8Q9D7M1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gid8Q9D7M1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gid8Q9D7M1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gid8Q9D7M1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gid8Q9D7M1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Gid8Q9D7M1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gid8Q9D7M1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gid8Q9D7M1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gid8Q9D7M1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gid8Q9D7M1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gid8Q9D7M1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gid8Q9D7M1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gid8Q9D7M1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gid8Q9D7M1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gid8Q9D7M1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gid8Q9D7M1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gid8Q9D7M1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gid8Q9D7M1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gid8Q9D7M1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gid8Q9D7M1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gid8Q9D7M1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gid8Q9D7M1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gid8Q9D7M1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gid8Q9D7M1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gid8Q9D7M1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gid8Q9D7M1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gid8Q9D7M1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gid8Q9D7M1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gid8Q9D7M1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gid8Q9D7M1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gid8Q9D7M1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gid8Q9D7M1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gid8Q9D7M1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gid8Q9D7M1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gid8Q9D7M1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gid8Q9D7M1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gid8Q9D7M1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gid8Q9D7M1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gid8Q9D7M1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gid8Q9D7M1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gid8Q9D7M1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gid8Q9D7M1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gid8Q9D7M1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gid8Q9D7M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gid8Q9D7M1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gid8Q9D7M1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gid8Q9D7M1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gid8Q9D7M1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gid8Q9D7M1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gid8Q9D7M1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gid8Q9D7M1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gid8Q9D7M1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gid8Q9D7M1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gid8Q9D7M1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gid8Q9D7M1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gid8Q9D7M1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gid8Q9D7M1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gid8Q9D7M1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms