Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6L8

Ppil3, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppil3Q9D6L8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppil3Q9D6L8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppil3Q9D6L8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppil3Q9D6L8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppil3Q9D6L8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppil3Q9D6L8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppil3Q9D6L8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppil3Q9D6L8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppil3Q9D6L8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppil3Q9D6L8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppil3Q9D6L8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppil3Q9D6L8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppil3Q9D6L8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppil3Q9D6L8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppil3Q9D6L8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppil3Q9D6L8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppil3Q9D6L8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppil3Q9D6L8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppil3Q9D6L8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppil3Q9D6L8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppil3Q9D6L8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppil3Q9D6L8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppil3Q9D6L8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppil3Q9D6L8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppil3Q9D6L8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppil3Q9D6L8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppil3Q9D6L8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppil3Q9D6L8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppil3Q9D6L8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppil3Q9D6L8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppil3Q9D6L8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppil3Q9D6L8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppil3Q9D6L8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppil3Q9D6L8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppil3Q9D6L8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppil3Q9D6L8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppil3Q9D6L8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppil3Q9D6L8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppil3Q9D6L8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppil3Q9D6L8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppil3Q9D6L8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppil3Q9D6L8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppil3Q9D6L8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppil3Q9D6L8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppil3Q9D6L8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppil3Q9D6L8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppil3Q9D6L8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppil3Q9D6L8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppil3Q9D6L8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppil3Q9D6L8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppil3Q9D6L8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppil3Q9D6L8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppil3Q9D6L8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppil3Q9D6L8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppil3Q9D6L8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppil3Q9D6L8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppil3Q9D6L8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppil3Q9D6L8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppil3Q9D6L8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppil3Q9D6L8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppil3Q9D6L8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppil3Q9D6L8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppil3Q9D6L8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppil3Q9D6L8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppil3Q9D6L8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppil3Q9D6L8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppil3Q9D6L8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppil3Q9D6L8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppil3Q9D6L8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppil3Q9D6L8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppil3Q9D6L8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppil3Q9D6L8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppil3Q9D6L8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppil3Q9D6L8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppil3Q9D6L8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppil3Q9D6L8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppil3Q9D6L8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppil3Q9D6L8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppil3Q9D6L8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppil3Q9D6L8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppil3Q9D6L8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppil3Q9D6L8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppil3Q9D6L8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppil3Q9D6L8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppil3Q9D6L8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppil3Q9D6L8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppil3Q9D6L8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppil3Q9D6L8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppil3Q9D6L8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppil3Q9D6L8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppil3Q9D6L8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppil3Q9D6L8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppil3Q9D6L8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppil3Q9D6L8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppil3Q9D6L8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms