Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Cfap57Q9D180 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cfap57Q9D180 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cfap57Q9D180 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cfap57Q9D180 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cfap57Q9D180 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Cfap57Q9D180 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cfap57Q9D180 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cfap57Q9D180 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap57Q9D180 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cfap57Q9D180 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cfap57Q9D180 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cfap57Q9D180 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cfap57Q9D180 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cfap57Q9D180 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cfap57Q9D180 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cfap57Q9D180 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cfap57Q9D180 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cfap57Q9D180 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cfap57Q9D180 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cfap57Q9D180 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cfap57Q9D180 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cfap57Q9D180 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap57Q9D180 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cfap57Q9D180 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cfap57Q9D180 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cfap57Q9D180 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cfap57Q9D180 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cfap57Q9D180 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cfap57Q9D180 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cfap57Q9D180 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cfap57Q9D180 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cfap57Q9D180 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cfap57Q9D180 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cfap57Q9D180 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cfap57Q9D180 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Cfap57Q9D180 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cfap57Q9D180 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cfap57Q9D180 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cfap57Q9D180 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Cfap57Q9D180 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cfap57Q9D180 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cfap57Q9D180 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cfap57Q9D180 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cfap57Q9D180 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cfap57Q9D180 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cfap57Q9D180 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cfap57Q9D180 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cfap57Q9D180 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cfap57Q9D180 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cfap57Q9D180 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Cfap57Q9D180 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cfap57Q9D180 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cfap57Q9D180 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cfap57Q9D180 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Cfap57Q9D180 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cfap57Q9D180 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cfap57Q9D180 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cfap57Q9D180 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cfap57Q9D180 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cfap57Q9D180 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cfap57Q9D180 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cfap57Q9D180 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cfap57Q9D180 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cfap57Q9D180 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cfap57Q9D180 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cfap57Q9D180 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cfap57Q9D180 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cfap57Q9D180 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cfap57Q9D180 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cfap57Q9D180 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cfap57Q9D180 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cfap57Q9D180 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cfap57Q9D180 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cfap57Q9D180 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cfap57Q9D180 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cfap57Q9D180 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cfap57Q9D180 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cfap57Q9D180 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cfap57Q9D180 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cfap57Q9D180 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cfap57Q9D180 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cfap57Q9D180 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cfap57Q9D180 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cfap57Q9D180 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cfap57Q9D180 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cfap57Q9D180 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cfap57Q9D180 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cfap57Q9D180 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfap57Q9D180 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cfap57Q9D180 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfap57Q9D180 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfap57Q9D180 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfap57Q9D180 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cfap57Q9D180 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
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