Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tubb2bQ9CWF2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Tubb2bQ9CWF2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Tubb2bQ9CWF2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Tubb2bQ9CWF2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Tubb2bQ9CWF2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tubb2bQ9CWF2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tubb2bQ9CWF2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tubb2bQ9CWF2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tubb2bQ9CWF2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tubb2bQ9CWF2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tubb2bQ9CWF2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tubb2bQ9CWF2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tubb2bQ9CWF2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tubb2bQ9CWF2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Tubb2bQ9CWF2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tubb2bQ9CWF2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tubb2bQ9CWF2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Tubb2bQ9CWF2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Tubb2bQ9CWF2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Tubb2bQ9CWF2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Tubb2bQ9CWF2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tubb2bQ9CWF2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tubb2bQ9CWF2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tubb2bQ9CWF2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tubb2bQ9CWF2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tubb2bQ9CWF2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Tubb2bQ9CWF2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Tubb2bQ9CWF2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tubb2bQ9CWF2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tubb2bQ9CWF2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tubb2bQ9CWF2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Tubb2bQ9CWF2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Tubb2bQ9CWF2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tubb2bQ9CWF2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tubb2bQ9CWF2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tubb2bQ9CWF2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Tubb2bQ9CWF2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tubb2bQ9CWF2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tubb2bQ9CWF2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tubb2bQ9CWF2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tubb2bQ9CWF2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tubb2bQ9CWF2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tubb2bQ9CWF2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tubb2bQ9CWF2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tubb2bQ9CWF2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tubb2bQ9CWF2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tubb2bQ9CWF2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tubb2bQ9CWF2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tubb2bQ9CWF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tubb2bQ9CWF2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubb2bQ9CWF2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tubb2bQ9CWF2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tubb2bQ9CWF2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tubb2bQ9CWF2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tubb2bQ9CWF2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tubb2bQ9CWF2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tubb2bQ9CWF2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tubb2bQ9CWF2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tubb2bQ9CWF2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tubb2bQ9CWF2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tubb2bQ9CWF2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tubb2bQ9CWF2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tubb2bQ9CWF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Tubb2bQ9CWF2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Tubb2bQ9CWF2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tubb2bQ9CWF2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tubb2bQ9CWF2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tubb2bQ9CWF2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubb2bQ9CWF2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tubb2bQ9CWF2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubb2bQ9CWF2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubb2bQ9CWF2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tubb2bQ9CWF2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tubb2bQ9CWF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tubb2bQ9CWF2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tubb2bQ9CWF2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tubb2bQ9CWF2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tubb2bQ9CWF2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubb2bQ9CWF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tubb2bQ9CWF2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tubb2bQ9CWF2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tubb2bQ9CWF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubb2bQ9CWF2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tubb2bQ9CWF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubb2bQ9CWF2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubb2bQ9CWF2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubb2bQ9CWF2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubb2bQ9CWF2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubb2bQ9CWF2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubb2bQ9CWF2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Tubb2bQ9CWF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubb2bQ9CWF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tubb2bQ9CWF2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tubb2bQ9CWF2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tubb2bQ9CWF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tubb2bQ9CWF2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms