Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Prps2Q9CS42 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prps2Q9CS42 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prps2Q9CS42 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Prps2Q9CS42 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Prps2Q9CS42 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Prps2Q9CS42 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Prps2Q9CS42 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Prps2Q9CS42 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Prps2Q9CS42 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prps2Q9CS42 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prps2Q9CS42 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Prps2Q9CS42 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Prps2Q9CS42 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prps2Q9CS42 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prps2Q9CS42 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prps2Q9CS42 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prps2Q9CS42 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prps2Q9CS42 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prps2Q9CS42 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prps2Q9CS42 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Prps2Q9CS42 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prps2Q9CS42 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prps2Q9CS42 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prps2Q9CS42 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prps2Q9CS42 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prps2Q9CS42 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prps2Q9CS42 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prps2Q9CS42 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prps2Q9CS42 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prps2Q9CS42 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prps2Q9CS42 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prps2Q9CS42 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prps2Q9CS42 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Prps2Q9CS42 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prps2Q9CS42 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prps2Q9CS42 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prps2Q9CS42 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prps2Q9CS42 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prps2Q9CS42 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prps2Q9CS42 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prps2Q9CS42 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prps2Q9CS42 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prps2Q9CS42 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Prps2Q9CS42 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prps2Q9CS42 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prps2Q9CS42 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prps2Q9CS42 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Prps2Q9CS42 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Prps2Q9CS42 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prps2Q9CS42 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prps2Q9CS42 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prps2Q9CS42 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prps2Q9CS42 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prps2Q9CS42 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Prps2Q9CS42 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prps2Q9CS42 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prps2Q9CS42 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prps2Q9CS42 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prps2Q9CS42 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Prps2Q9CS42 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prps2Q9CS42 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prps2Q9CS42 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prps2Q9CS42 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prps2Q9CS42 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prps2Q9CS42 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prps2Q9CS42 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prps2Q9CS42 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prps2Q9CS42 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prps2Q9CS42 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prps2Q9CS42 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prps2Q9CS42 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prps2Q9CS42 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prps2Q9CS42 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prps2Q9CS42 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prps2Q9CS42 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prps2Q9CS42 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prps2Q9CS42 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prps2Q9CS42 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prps2Q9CS42 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prps2Q9CS42 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prps2Q9CS42 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Prps2Q9CS42 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prps2Q9CS42 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prps2Q9CS42 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prps2Q9CS42 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prps2Q9CS42 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prps2Q9CS42 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prps2Q9CS42 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prps2Q9CS42 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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