Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB0

Snx24, Sorting nexin-24, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx24Q9CRB0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Snx24Q9CRB0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Snx24Q9CRB0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Snx24Q9CRB0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Snx24Q9CRB0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Snx24Q9CRB0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Snx24Q9CRB0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Snx24Q9CRB0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Snx24Q9CRB0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Snx24Q9CRB0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Snx24Q9CRB0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Snx24Q9CRB0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Snx24Q9CRB0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Snx24Q9CRB0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Snx24Q9CRB0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Snx24Q9CRB0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Snx24Q9CRB0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Snx24Q9CRB0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx24Q9CRB0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Snx24Q9CRB0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Snx24Q9CRB0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Snx24Q9CRB0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Snx24Q9CRB0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Snx24Q9CRB0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Snx24Q9CRB0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Snx24Q9CRB0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Snx24Q9CRB0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Snx24Q9CRB0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Snx24Q9CRB0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Snx24Q9CRB0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Snx24Q9CRB0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Snx24Q9CRB0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Snx24Q9CRB0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx24Q9CRB0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Snx24Q9CRB0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Snx24Q9CRB0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Snx24Q9CRB0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Snx24Q9CRB0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snx24Q9CRB0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Snx24Q9CRB0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Snx24Q9CRB0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Snx24Q9CRB0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Snx24Q9CRB0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Snx24Q9CRB0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Snx24Q9CRB0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Snx24Q9CRB0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Snx24Q9CRB0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx24Q9CRB0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Snx24Q9CRB0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx24Q9CRB0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx24Q9CRB0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Snx24Q9CRB0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx24Q9CRB0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx24Q9CRB0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snx24Q9CRB0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx24Q9CRB0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snx24Q9CRB0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx24Q9CRB0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snx24Q9CRB0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snx24Q9CRB0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snx24Q9CRB0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Snx24Q9CRB0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Snx24Q9CRB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx24Q9CRB0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snx24Q9CRB0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx24Q9CRB0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snx24Q9CRB0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx24Q9CRB0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx24Q9CRB0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snx24Q9CRB0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snx24Q9CRB0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snx24Q9CRB0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snx24Q9CRB0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snx24Q9CRB0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx24Q9CRB0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snx24Q9CRB0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx24Q9CRB0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snx24Q9CRB0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snx24Q9CRB0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx24Q9CRB0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx24Q9CRB0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snx24Q9CRB0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx24Q9CRB0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx24Q9CRB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx24Q9CRB0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx24Q9CRB0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx24Q9CRB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx24Q9CRB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx24Q9CRB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx24Q9CRB0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snx24Q9CRB0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx24Q9CRB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx24Q9CRB0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx24Q9CRB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snx24Q9CRB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx24Q9CRB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx24Q9CRB0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx24Q9CRB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx24Q9CRB0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx24Q9CRB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms