Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PsenenQ9CQR7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PsenenQ9CQR7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PsenenQ9CQR7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PsenenQ9CQR7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PsenenQ9CQR7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PsenenQ9CQR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PsenenQ9CQR7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PsenenQ9CQR7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PsenenQ9CQR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PsenenQ9CQR7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PsenenQ9CQR7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PsenenQ9CQR7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PsenenQ9CQR7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PsenenQ9CQR7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PsenenQ9CQR7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PsenenQ9CQR7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PsenenQ9CQR7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PsenenQ9CQR7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PsenenQ9CQR7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PsenenQ9CQR7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PsenenQ9CQR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PsenenQ9CQR7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PsenenQ9CQR7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PsenenQ9CQR7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PsenenQ9CQR7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PsenenQ9CQR7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PsenenQ9CQR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PsenenQ9CQR7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PsenenQ9CQR7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PsenenQ9CQR7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PsenenQ9CQR7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PsenenQ9CQR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PsenenQ9CQR7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PsenenQ9CQR7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PsenenQ9CQR7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PsenenQ9CQR7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PsenenQ9CQR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PsenenQ9CQR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PsenenQ9CQR7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PsenenQ9CQR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PsenenQ9CQR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PsenenQ9CQR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PsenenQ9CQR7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PsenenQ9CQR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PsenenQ9CQR7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PsenenQ9CQR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PsenenQ9CQR7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PsenenQ9CQR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PsenenQ9CQR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PsenenQ9CQR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PsenenQ9CQR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PsenenQ9CQR7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PsenenQ9CQR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PsenenQ9CQR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PsenenQ9CQR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PsenenQ9CQR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PsenenQ9CQR7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PsenenQ9CQR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PsenenQ9CQR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PsenenQ9CQR7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PsenenQ9CQR7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PsenenQ9CQR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PsenenQ9CQR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PsenenQ9CQR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PsenenQ9CQR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PsenenQ9CQR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PsenenQ9CQR7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PsenenQ9CQR7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PsenenQ9CQR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PsenenQ9CQR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PsenenQ9CQR7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PsenenQ9CQR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PsenenQ9CQR7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PsenenQ9CQR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PsenenQ9CQR7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PsenenQ9CQR7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PsenenQ9CQR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PsenenQ9CQR7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PsenenQ9CQR7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PsenenQ9CQR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PsenenQ9CQR7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PsenenQ9CQR7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PsenenQ9CQR7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PsenenQ9CQR7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PsenenQ9CQR7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PsenenQ9CQR7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PsenenQ9CQR7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PsenenQ9CQR7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PsenenQ9CQR7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms