Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nicn1Q9CQM0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nicn1Q9CQM0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nicn1Q9CQM0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nicn1Q9CQM0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nicn1Q9CQM0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nicn1Q9CQM0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nicn1Q9CQM0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nicn1Q9CQM0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nicn1Q9CQM0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nicn1Q9CQM0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nicn1Q9CQM0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nicn1Q9CQM0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nicn1Q9CQM0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nicn1Q9CQM0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nicn1Q9CQM0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nicn1Q9CQM0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nicn1Q9CQM0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nicn1Q9CQM0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nicn1Q9CQM0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nicn1Q9CQM0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nicn1Q9CQM0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nicn1Q9CQM0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nicn1Q9CQM0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nicn1Q9CQM0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nicn1Q9CQM0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nicn1Q9CQM0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nicn1Q9CQM0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nicn1Q9CQM0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nicn1Q9CQM0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nicn1Q9CQM0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nicn1Q9CQM0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nicn1Q9CQM0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nicn1Q9CQM0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nicn1Q9CQM0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nicn1Q9CQM0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nicn1Q9CQM0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nicn1Q9CQM0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nicn1Q9CQM0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nicn1Q9CQM0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nicn1Q9CQM0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nicn1Q9CQM0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nicn1Q9CQM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nicn1Q9CQM0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nicn1Q9CQM0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nicn1Q9CQM0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nicn1Q9CQM0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nicn1Q9CQM0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nicn1Q9CQM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nicn1Q9CQM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nicn1Q9CQM0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nicn1Q9CQM0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nicn1Q9CQM0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nicn1Q9CQM0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nicn1Q9CQM0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nicn1Q9CQM0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nicn1Q9CQM0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nicn1Q9CQM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nicn1Q9CQM0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nicn1Q9CQM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nicn1Q9CQM0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nicn1Q9CQM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nicn1Q9CQM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nicn1Q9CQM0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nicn1Q9CQM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nicn1Q9CQM0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nicn1Q9CQM0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nicn1Q9CQM0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nicn1Q9CQM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nicn1Q9CQM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nicn1Q9CQM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nicn1Q9CQM0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nicn1Q9CQM0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nicn1Q9CQM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nicn1Q9CQM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nicn1Q9CQM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nicn1Q9CQM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nicn1Q9CQM0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nicn1Q9CQM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nicn1Q9CQM0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nicn1Q9CQM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nicn1Q9CQM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nicn1Q9CQM0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nicn1Q9CQM0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nicn1Q9CQM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nicn1Q9CQM0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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