Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rwdd1Q9CQK7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rwdd1Q9CQK7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rwdd1Q9CQK7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rwdd1Q9CQK7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rwdd1Q9CQK7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rwdd1Q9CQK7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rwdd1Q9CQK7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rwdd1Q9CQK7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rwdd1Q9CQK7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rwdd1Q9CQK7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rwdd1Q9CQK7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rwdd1Q9CQK7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rwdd1Q9CQK7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rwdd1Q9CQK7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Rwdd1Q9CQK7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rwdd1Q9CQK7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rwdd1Q9CQK7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rwdd1Q9CQK7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rwdd1Q9CQK7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rwdd1Q9CQK7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rwdd1Q9CQK7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rwdd1Q9CQK7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rwdd1Q9CQK7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Rwdd1Q9CQK7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rwdd1Q9CQK7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rwdd1Q9CQK7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rwdd1Q9CQK7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rwdd1Q9CQK7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rwdd1Q9CQK7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rwdd1Q9CQK7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rwdd1Q9CQK7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rwdd1Q9CQK7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rwdd1Q9CQK7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rwdd1Q9CQK7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rwdd1Q9CQK7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rwdd1Q9CQK7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rwdd1Q9CQK7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rwdd1Q9CQK7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rwdd1Q9CQK7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rwdd1Q9CQK7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rwdd1Q9CQK7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rwdd1Q9CQK7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rwdd1Q9CQK7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rwdd1Q9CQK7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rwdd1Q9CQK7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rwdd1Q9CQK7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rwdd1Q9CQK7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rwdd1Q9CQK7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rwdd1Q9CQK7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rwdd1Q9CQK7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rwdd1Q9CQK7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rwdd1Q9CQK7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rwdd1Q9CQK7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rwdd1Q9CQK7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rwdd1Q9CQK7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rwdd1Q9CQK7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rwdd1Q9CQK7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rwdd1Q9CQK7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Rwdd1Q9CQK7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rwdd1Q9CQK7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rwdd1Q9CQK7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rwdd1Q9CQK7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rwdd1Q9CQK7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rwdd1Q9CQK7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rwdd1Q9CQK7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rwdd1Q9CQK7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Rwdd1Q9CQK7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rwdd1Q9CQK7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rwdd1Q9CQK7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rwdd1Q9CQK7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rwdd1Q9CQK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rwdd1Q9CQK7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms