Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ61

Unc50, Protein unc-50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc50Q9CQ61 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Unc50Q9CQ61 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Unc50Q9CQ61 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Unc50Q9CQ61 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Unc50Q9CQ61 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Unc50Q9CQ61 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Unc50Q9CQ61 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Unc50Q9CQ61 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Unc50Q9CQ61 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Unc50Q9CQ61 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Unc50Q9CQ61 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Unc50Q9CQ61 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Unc50Q9CQ61 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Unc50Q9CQ61 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Unc50Q9CQ61 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Unc50Q9CQ61 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Unc50Q9CQ61 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Unc50Q9CQ61 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Unc50Q9CQ61 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Unc50Q9CQ61 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Unc50Q9CQ61 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Unc50Q9CQ61 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Unc50Q9CQ61 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Unc50Q9CQ61 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Unc50Q9CQ61 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Unc50Q9CQ61 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Unc50Q9CQ61 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Unc50Q9CQ61 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Unc50Q9CQ61 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Unc50Q9CQ61 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Unc50Q9CQ61 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Unc50Q9CQ61 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Unc50Q9CQ61 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Unc50Q9CQ61 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Unc50Q9CQ61 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Unc50Q9CQ61 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Unc50Q9CQ61 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Unc50Q9CQ61 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Unc50Q9CQ61 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Unc50Q9CQ61 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Unc50Q9CQ61 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Unc50Q9CQ61 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Unc50Q9CQ61 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Unc50Q9CQ61 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Unc50Q9CQ61 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Unc50Q9CQ61 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Unc50Q9CQ61 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Unc50Q9CQ61 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Unc50Q9CQ61 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Unc50Q9CQ61 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Unc50Q9CQ61 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Unc50Q9CQ61 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Unc50Q9CQ61 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Unc50Q9CQ61 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Unc50Q9CQ61 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Unc50Q9CQ61 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Unc50Q9CQ61 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Unc50Q9CQ61 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Unc50Q9CQ61 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Unc50Q9CQ61 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Unc50Q9CQ61 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Unc50Q9CQ61 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Unc50Q9CQ61 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Unc50Q9CQ61 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Unc50Q9CQ61 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Unc50Q9CQ61 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Unc50Q9CQ61 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Unc50Q9CQ61 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Unc50Q9CQ61 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Unc50Q9CQ61 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Unc50Q9CQ61 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Unc50Q9CQ61 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc50Q9CQ61 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Unc50Q9CQ61 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Unc50Q9CQ61 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Unc50Q9CQ61 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Unc50Q9CQ61 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Unc50Q9CQ61 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Unc50Q9CQ61 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Unc50Q9CQ61 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Unc50Q9CQ61 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Unc50Q9CQ61 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Unc50Q9CQ61 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Unc50Q9CQ61 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Unc50Q9CQ61 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Unc50Q9CQ61 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Unc50Q9CQ61 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Unc50Q9CQ61 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Unc50Q9CQ61 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Unc50Q9CQ61 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Unc50Q9CQ61 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Unc50Q9CQ61 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Unc50Q9CQ61 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Unc50Q9CQ61 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Unc50Q9CQ61 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms