Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnaseh2cQ9CQ18 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnaseh2cQ9CQ18 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnaseh2cQ9CQ18 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnaseh2cQ9CQ18 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnaseh2cQ9CQ18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnaseh2cQ9CQ18 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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